| 甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析 |
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| 引用本文： | 陶鹏,钟新民,李必元,王五宏,岳智臣,雷娟利. 甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析[J]. 分子植物育种, 2015, 0(5) |
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| 作者姓名： | 陶鹏 钟新民 李必元 王五宏 岳智臣 雷娟利 |
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| 作者单位： | 浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州,310021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目,中国博士后科学基金,浙江省博士后科研项目 |
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| 摘 要： | 多聚腺苷酸化(Polyadenylation)是真核生物中一种重要的pre-mRNA加工机制,是mRNA成熟的一个必经过程。为了解甘蓝BoKIN1基因的多聚腺苷酸化加工情况,本研究从甘蓝全基因组数据库中下载得到BoKIN1基因序列,并利用生物信息学手段分析了BoKIN1的基因结构和基因表达。研究结果显示:BoKIN1基因在花器官中表达最高;然后基于EST文库发现了3个ploy(A)位点,并计算了这些ploy(A)位点在premRNA加工过程中被选择的大致频率情况,结果显示BoKIN1基因在pre-mRNA加工过程中至少有6个ploy(A)位点可供选择加尾,其中AP4位点被选择加尾的频率最高,其次是AP5位点。因此选择AP4位点加尾后形成的mRNA是转录后加工的主要产物。通过本研究我们确定了甘蓝类BoKIN1基因6个选择性加尾位点及其3'UTR的主要产物和次要产物,可对于未来进一步利用这些3'UTR奠定基础。
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| 关 键 词： | 甘蓝 BoKIN1 表达 ploy(A)位点 ploy(A)频率 |
Prediction and Frequency Analysis of ploy (A) Sites of BoK IN1 Gene of Cabbage (Brassica oleracea L.) |
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| Tao Peng,Zhong Xinmin,Li Biyuan,Wang Wuhong,Yue Zhichen,Lei Juanli. Prediction and Frequency Analysis of ploy (A) Sites of BoK IN1 Gene of Cabbage (Brassica oleracea L.)[J]. Molecular Plant Breeding, 2015, 0(5) |
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| Authors: | Tao Peng Zhong Xinmin Li Biyuan Wang Wuhong Yue Zhichen Lei Juanli |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica oleracea L. BoKIN1 Gene expression ploy(A) sites ploy(A) frequency |
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