| 基于生物信息学的小麦ALAD基因的鉴定和分析 |
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| 引用本文： | 蒋宏宝,王 娜,简俊涛,张 震,许喜棠,张小燕,魏红升,王成社,谢彦周. 基于生物信息学的小麦ALAD基因的鉴定和分析[J]. 麦类作物学报, 2018, 0(11): 1281-1287 |
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| 作者姓名： | 蒋宏宝 王 娜 简俊涛 张 震 许喜棠 张小燕 魏红升 王成社 谢彦周 |
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| 作者单位： | （1.西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室，陕西杨凌712100； 2.南阳市农业科学院，河南南阳 473000） |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目（2016YFD0102101）；陕西省科技统筹创新工程计划项目（2015KTZDNY01-01-02）；西北农林科技大学南阳小麦试验示范站建设项目；西北农林科技大学唐仲英育种基金项目 |
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| 摘 要： | 5-氨基乙酰丙酸脱水酶(δ-aminoaevulinic acid dehydratase,ALAD)是生物体所有四吡咯化合物生物合成所必需的酶。为了给ALAD基因功能研究奠定基础,本研究根据模式植物拟南芥和水稻的ALAD基因序列,利用生物信息学手段对普通小麦ALAD基因进行鉴定和分析。结果表明,普通小麦有6个ALAD基因,其中TaALAD-A1、TaALAD-B1和TaALAD-D1基因位于第七同源群染色体长臂,而TaALAD-A2、TaALAD-B2和TaALAD-D2基因位于第六同源群染色体短臂。6个ALAD基因均含有保守的ALAD结构域,但系统发育分析中可分为2组。转录组数据表达分析结果显示,TaALAD-1基因在各个组织中的表达量均高于TaALAD-2,但两者在叶片中的表达量均最高。干旱胁迫对小麦TaALAD-1和TaALAD-2的表达几乎无影响;TaALAD-1的表达量在热胁迫1h下调,而在热胁迫6h时上调;热胁迫1h和6h对TaALAD-2的表达几乎无影响。通过小麦TILLING数据库分析,6个TaALAD基因都找到了数量不同的突变位点,其中一些突变位点为起始位点突变、无义突变、转录终止位点突变和剪切位点突变,可能影响该基因的功能。
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| 关 键 词： | 普通小麦；ALAD基因；表达分析；突变体分析 |
Identification and Analysis of ALAD Genes in Triticum aestivum Based on Bioinformatics |
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| JIANG Hongbao,WANG N,JIAN Juntao,ZHANG Zhen,XU Xitang,ZHANG Xiaoyan,WEI Hongsheng,WANG Chengshe,XIE Yanzhou. Identification and Analysis of ALAD Genes in Triticum aestivum Based on Bioinformatics[J]. Journal of Triticeae Crops, 2018, 0(11): 1281-1287 |
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| Authors: | JIANG Hongbao WANG N JIAN Juntao ZHANG Zhen XU Xitang ZHANG Xiaoyan WEI Hongsheng WANG Chengshe XIE Yanzhou |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Triticum aestivum L. ALAD genes Expression analysis Mutation analysis |
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