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二穗短柄草SPL家族基因的鉴定、系统发育和表达分析
引用本文:王淑婷,朱 婷,马浩森,李小鹏,牛 娜,马翎健.二穗短柄草SPL家族基因的鉴定、系统发育和表达分析[J].麦类作物学报,2023(11):1372-1383.
作者姓名:王淑婷  朱 婷  马浩森  李小鹏  牛 娜  马翎健
作者单位:(1.西北农林科技大学农学院,陕西杨凌 712100; 2.渭南市农资农产品质量检测中心,陕西渭南 714000)
摘    要:植物特异性SPL家族基因编码SBP(squamosa promoter-binding protein-like)保守结构,参与调节植物的生长和发育。为了解二穗短柄草中SPL家族基因的分布、结构及功能,对二穗短柄草全基因组中SPL家族成员进行了系统分析。结果表明,在二穗短柄草全基因组中鉴定出17个BdSPL基因,在5条染色体上呈不均匀分布,bd03号染色体上分布最多;根据系统发育树,17个BdSPL被分为6个组,同组成员有保守的结构和基序;其中6对 BdSPL基因发生基因复制事件;在BdSPL基因启动子区域发现了各种顺式元件,如ABRE、CGTAC-motif和LTR。转录组数据和qRT-PCR分析显示,BdSPL基因在二穗短柄草花中表达量较高,而在根系中表达量较低,在不同植物激素处理下表达量有差异。

关 键 词:二穗短柄草  SPL基因家族  系统进化  表达分析

Identification, Phylogeny and Expression Analysis of the SPL Gene Family in B. distachyon.
WANG Shuting,ZHU Ting,MA Haosen,LI Xiaopeng,NIU N,MA Lingjian.Identification, Phylogeny and Expression Analysis of the SPL Gene Family in B. distachyon.[J].Journal of Triticeae Crops,2023(11):1372-1383.
Authors:WANG Shuting  ZHU Ting  MA Haosen  LI Xiaopeng  NIU N  MA Lingjian
Institution:(1.College of Agronomy, Northwest A&F University, Yangling, Shaanxi 712100, China; 2.Weinan Agricultural Products Quality Testing Center, Weinan, Shaanxi 714000, China)
Abstract:
Keywords:Brachypodium distachyon  SPL gene family  Phylogeny  Expression patterns
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