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抗性稗草1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因的克隆与表达分析
引用本文:董明超,杨霞,张自常,李永丰,管荣展.抗性稗草1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因的克隆与表达分析[J].中国农业科学,2015,48(20):4077-4085.
作者姓名:董明超  杨霞  张自常  李永丰  管荣展
作者单位:1南京农业大学农学院,南京 210095 2江苏省农业科学院植物保护研究所,南京 210014
基金项目:国家自然科学基金(31371953)、国家公益性行业(农业)科研专项(201303031)、江苏省农业科技自主创新资金(SCX(13)3063)
摘    要:【目的】克隆稗草(Echinochloa crus-galli)乙烯生物合成途径关键酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因(EcACO),对其进行表达分析和酶活性测定,以探究稗草抗二氯喹啉酸的机理。【方法】根据转录组测序所得EcACO部分序列设计引物,分别从二氯喹啉酸的抗性和敏感型稗草中克隆EcACO的全长序列,用DNAman以及GeneDOC等软件进行序列分析。用qRT-PCR方法分析抗性和敏感性稗草间的EcACO表达水平差异。最后分别将抗性和敏感性稗草EcACO的开放阅读框(ORF)序列连接至原核表达载体pMAL-c5x中,并转化至大肠杆菌菌株BL21,经终浓度为0.4 mmol·L-1的IPTG于18℃诱导16 h后,检测EcACO蛋白的表达情况。采用MBP吸附柱分离纯化EcACO蛋白后,通过测定乙烯释放量,测定抗性和敏感稗草EcACO蛋白间的活性差异。【结果】克隆得到抗性稗草和敏感稗草EcACO,其编码区序列长度为936 bp,预测蛋白含311个氨基酸残基,蛋白分子量大小和理论等电点分别为35 kD和5.4。序列比对表明,抗性稗草EcACO氨基酸序列与粟(Setaria italica)、玉米(Zea mays)、高粱(Sorghum bicolor)同源性分别为93%、92%和91%;与敏感性稗草EcACO相比,抗性稗草EcACO的氨基酸序列存在5个突变位点,其中有3个突变位点位于保守功能域上。qPCR分析显示,EcACO在抗性和敏感性稗草中并无明显的表达水平差异。原核蛋白表达和酶活性测定结果表明,敏感型稗草MBP::EcACO融合蛋白单位时间内产生的乙烯释放量是抗性稗草MBP::EcACO融合蛋白的2.15倍,因而该基因可能解释了稗草的抗药性机理。【结论】从抗二氯喹啉酸的稗草中克隆了EcACO,发现了与抗性相关的5个氨基酸突变位点,其中的3个位点突变位于保守结构域,这可能是引起乙烯释放速率降低以及稗草产生二氯喹啉酸抗性的原因。

关 键 词:稗草  1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶  基因克隆  点突变  表达  
收稿时间:2015-04-20

Identification and Expression Analysis of 1-Aminocyclopropane- 1-Carboxylate Oxidase Gene from Quinclorac-Resistant Barnyardgrass (Echinochloa crus-galli)
DONG Ming-chao,YANG Xia,ZHANG Zi-chang,LI Yong-feng,GUAN Rong-zhan.Identification and Expression Analysis of 1-Aminocyclopropane- 1-Carboxylate Oxidase Gene from Quinclorac-Resistant Barnyardgrass (Echinochloa crus-galli)[J].Scientia Agricultura Sinica,2015,48(20):4077-4085.
Authors:DONG Ming-chao  YANG Xia  ZHANG Zi-chang  LI Yong-feng  GUAN Rong-zhan
Institution:1College of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095 2Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014
Abstract:
Keywords:Echinochloa crus-galli  1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase  gene cloning  site mutation  expression
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