| 松材线虫组DNA条形码筛选 |
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| 引用本文： | 何洁,顾建锋. 松材线虫组DNA条形码筛选[J]. 植物检疫, 2016, 0(1): 14-20 |
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| 作者姓名： | 何洁 顾建锋 |
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| 作者单位： | 宁波出入境检验检疫局 浙江宁波315012 |
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| 基金项目： | 宁波市科技创新团队(2015C110018)，国家科技支撑计划(2012BAK11B03)，国家质量监督检验检疫总局科研项目(2013IK279;2015IK023)，宁波市自然科学基金项目(2014A610197) |
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| 摘 要： | 本文基于Gen Bank中登录的14种松材线虫组线虫的28S、18S和ITS部分基因DNA序列,利用遗传距离法及分子生物学方法评价其各自作为松材线虫组DNA条形码序列的适用性。结果显示,28S(拟松材线虫不分亚种)、28S(拟松材线虫分亚种)、18S和ITS的基因序列种内成对遗传距离平均值分别为0.0071、0.0030、0.0007、0.0043,种间成对遗传距离平均值分别为0.0476、0.0454、0.0052、0.1556,其中28S、18S基因序列种内及种间距离存在一定程度的重叠,ITS具有一定程度的Barcoding gap。3个基因序列构建的NJ进化树显示,28S、ITS构建的系统进化树具有较高的节点支持率,可以有效将14个松材线虫组线虫分离成独立分支,而且28S可以有效鉴别出拟松材线虫的2个亚种;基于18S基因构建的进化树不能对吉拉尼伞滑刃线虫、日本冷杉伞滑刃线虫、拟松材线虫进行有效区分。因此,28S、ITS区具有一定的遗传距离间隔以及相对较高的物种识别率,可以作为松材线虫组线虫候选条形码基因。
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| 关 键 词： | 松材线虫组 DNA条形码 28S 18S ITS |
Screening DNA barcode markers for the xylophilus group of the genus Bursaphelenchus |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | The xylophilus group DNA barcode 28S 18S ITS |
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