| 线粒体COI基因作为根结线虫条形码的适用性分析 |
| |
| 引用本文： | 林宇,王金成,张瑞峰,陈先锋,顾建锋,李红梅.线粒体COI基因作为根结线虫条形码的适用性分析[J].植物检疫,2016(2):34-39. |
| |
| 作者姓名： | 林宇 王金成 张瑞峰 陈先锋 顾建锋 李红梅 |
| |
| 作者单位： | 1. 天津出入境检验检疫局 天津 300456;南京农业大学;2. 天津出入境检验检疫局 天津 300456;3. 宁波出入境检验检疫局;4. 南京农业大学 |
| |
| 基金项目： | 国家质检总局课题(2011IK176)，国家科技支撑计划项目(2012BAK11B03)，天津局科技项目(2013TK072) |
| |
| 摘 要： | 为评估线粒体COI基因作为根结线虫(Meloidogyne spp.)DNA条形码的适用性,对收集的25个根结线虫群体的线粒体COI基因进行扩增、测序,检测其扩增和测序成功率。将测序获得的COI基因序列与Q-bank中下载的根结线虫COI基因序列共同进行比对分析,利用MEGA 6.0计算种内、种间遗传距离进行"Barcoding Gap"检验以及构建NJ系统进化树作聚类分析,检验COI基因对根结线虫的物种识别能力。结果表明:线粒体COI基因扩增和测序成功率极高,扩增成功率达96%,测序成功率为100%。种间平均遗传距离为0.126,远远超过种内平均遗传距离0.002的10倍,种内遗传距离与种间遗传距离存在明显的"Barcoding Gap"间隔区。系统发育分析显示,COI基因可有效分辨出本研究15种根结线虫中的10种,物种识别率约为67%。线粒体COI基因具有极高的扩增和测序成功率、较高的物种识别能力,且扩增片段长度适宜,符合物种鉴定DNA条形码基因的标准,可作为根结线虫候选条形码基因。
|
| 关 键 词： | 根结线虫 DNA条形码 线粒体细胞色素C氧化酶I基因 物种鉴定 |
Suitability analysis of mitochondrial COI gene used as DNA barcode for root-knot nematodes |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | root-knot nematodes DNA barcode COI species identification |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
