| 基于转录组的小豆SSR分子标记开发及其应用 |
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| 引用本文： | 徐晓丹,冷淼,张明媛,柯希望,殷丽华,左豫虎. 基于转录组的小豆SSR分子标记开发及其应用[J]. 干旱地区农业研究, 2023, 0(1): 13-18 |
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| 作者姓名： | 徐晓丹 冷淼 张明媛 柯希望 殷丽华 左豫虎 |
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| 作者单位： | 黑龙江省作物-有害生物互作生物学及生态防控重点实验室，国家杂粮工程技术研究中心，黑龙江八一农垦大学，黑龙江 大庆 163319 |
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| 基金项目： | 黑龙江省应用技术研究与开发计划（GA19B104）；大庆市科学技术局指导项目（zd-2020-45）；黑龙江八一农垦大学校启动计划（2031011068） |
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| 摘 要： | 为了开发小豆SSR(Simple Sequence Repeats)分子标记，2019—2020年，利用微卫星识别工具MISA和软件Primer 3搜索小豆资源QH1转录组测序得到的Unigene,获得3 045个SSR分子标记，通过对标记的重复基序特点分析，发现标记的重复基序以单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复为主，分别占标记总数的41.2%、26.4%和25.6%。利用可以锚定到小豆基因组并能成功设计引物的标记，构建了包括1 505个SSR分子标记的物理图谱。从以上1 505个标记中，随机选取分布于小豆11条染色体上的132个SSR标记进行有效性验证，发现有效扩增的标记为118个，有效率为89.4%。通过多态性标记筛选，获得6个多态性标记，利用这6个标记对36份小豆品种进行聚类分析，发现供试小豆材料可以分为4个类群。说明开发的SSR分子标记能够分析小豆的遗传背景差异，为小豆种质资源鉴定、遗传多样性分析以及优良性状基因定位研究提供可用的分子标记。
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| 关 键 词： | 小豆 转录组 SSR 分子标记 |
Development and application of SSR molecular markers based on transcriptome sequencing of adzuki bean |
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| XU Xiaodan,LENG Miao,ZHANG Mingyuan,KE Xiwang,YIN Lihu,ZUO Yuhu. Development and application of SSR molecular markers based on transcriptome sequencing of adzuki bean[J]. Agricultural Research in the Arid Areas, 2023, 0(1): 13-18 |
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| Authors: | XU Xiaodan LENG Miao ZHANG Mingyuan KE Xiwang YIN Lihu ZUO Yuhu |
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| Affiliation: | Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Crop|Pest Interaction Biology and Ecological Control, National Coarse Cereals Engineering Research Center, Heilongjiang Bayi Agricultural University, Daqing, Heilongjiang 163319, China |
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