基于IRAP标记的沙子空心李遗传多样性评价及指纹图谱构建 |
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引用本文: | 王贵,李蕊蕊,吴茂宏,任菲宏,王丽丽,乔光.基于IRAP标记的沙子空心李遗传多样性评价及指纹图谱构建[J].华中农业大学学报,2023,42(1):1-11. |
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作者姓名: | 王贵 李蕊蕊 吴茂宏 任菲宏 王丽丽 乔光 |
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作者单位: | 1.贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵阳 550025;2.贵州省铜仁市林业科学院,铜仁 554300;3.贵州省铜仁市农业科学院,铜仁 554300;4.贵州省农业科学院,贵阳 550006 |
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基金项目: | 贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]1Y023);贵州省科技计划项目(黔科合服企[2019]4013);中央引导地方科技发展资金项目(黔科中引地[2021]4010) |
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摘 要: | 通过走访调查,选取92株具有优良性状的沙子空心李种质,根据李反转录转座子的RT序列开发IRAP标记引物,设计L16(43)的正交试验优化10μL IRAP-PCR主要影响因素的含量;利用18条IRAP引物对92份沙子空心李进行遗传多样性分析,构建供试种质的指纹图谱。结果显示:最优的10μL IRAP-PCR反应体系为10-5 mol/L IRAP引物l.3μL,PCR Mix 5.0μL、模板DNA(30 ng/μL) l.0μL,PCR循环40次。18条IRAP引物共扩增出189个位点,多态性位点180个,等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数和Shannon指数均值分别为1.930、1.426、0.261及0.405。采用邻接法将92份沙子空心李聚类为4个类群。确定IRAP引物Ty3-2及Ty3-6为核心引物,可高效构建92份供试种质的指纹图谱。
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关 键 词: | 沙子空心李 种质资源 分子标记 IRAP 指纹图谱 遗传多样性 种质创新 |
收稿时间: | 2022/8/30 0:00:00 |
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