| 桂花EST-SSR引物开发及在品种鉴定中的应用 |
| |
| 引用本文： | 李军,董彬,张超,付建新,胡绍庆,赵宏波. 桂花EST-SSR引物开发及在品种鉴定中的应用[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(2): 306-313. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.02.015 |
| |
| 作者姓名： | 李军 董彬 张超 付建新 胡绍庆 赵宏波 |
| |
| 作者单位： | 1.浙江农林大学 风景园林与建筑学院, 浙江 杭州 3113002.浙江理工大学 建筑工程学院, 浙江 杭州 310000 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目31501790国家自然科学基金资助项目31170656浙江省自然科学基金资助项目LQ15C160004浙江省农业新品种选育重大科技专项2016C02056-12 |
| |
| 摘 要： | 利用L16（45）正交实验设计，针对模板DNA，镁离子（Mg2+），dNTPs，TaqDNA酶和引物5个因素进行正交优化，建立适用于桂花Osmanthus fragrans表达序列标签-简单重复序列（EST-SSR）的最优扩增反应体系，将其用于桂花转录组EST-SSR多态性引物的筛选，最后利用筛选得到的多态性引物和聚类分析对14份四川省常见的栽培丹桂（SC01~SC14）样本进行品种鉴定。结果表明:桂花EST-SSR最优反应体系包含40 ng模板DNA，2.25 mmol·L-1 Mg2+，0.3 μmol·L-1引物，0.3 mmol·L-1 dNTPs，1.25×16.67 nkat TaqDNA聚合酶，10×PCR Buffer缓冲液2 μL，双蒸水补至20 μL；从150对EST-SSR引物中筛选得到了19对稳定性好、多态性高的SSR引物，多态性从高到低依次为五核苷酸（25.00%），六核苷酸（19.44%）和三核苷酸（16.67%）重复类型。利用筛选得到的3对高度多态性SSR引物（OF8623-1677，OF24299-844和OF28774-2088）对四川省成都市周边常见栽培的14份丹桂（Aurantiacus group）样本进行了有效鉴定。结果表明:14份样本中，有12份可判定为‘朱砂丹桂’‘Zhusha Dangui’，SC06为‘堰红桂’‘Yanhong Gui’，SC08与‘满条红’‘Mantiao Hong’和‘状元红’‘Zhuangyuan Hong’亲缘关系较近。本研究也为今后利用EST-SSR标记对桂花指纹图谱构建、遗传多样性分析、分子育种及品种鉴定与保护等工作奠定基础。
|
| 关 键 词： | 植物学 桂花 EST-SSR 体系优化 引物筛选 品种鉴定 |
| 收稿时间： | 2017-03-28 |
EST-SSR primers and their application in cultivar identification of Osmanthus fragrans |
| |
| LI Jun,DONG Bin,ZHANG Chao,FU Jianxin,HU Shaoqing,ZHAO Hongbo. EST-SSR primers and their application in cultivar identification of Osmanthus fragrans[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(2): 306-313. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.02.015 |
| |
| Authors: | LI Jun DONG Bin ZHANG Chao FU Jianxin HU Shaoqing ZHAO Hongbo |
| |
| Affiliation: | 1.School of Landscape Architecture, Zhejiang A & F University, Hangzhou 311300, Zhejiang, China2.College of Civil Engineering and Architecture, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou 310018, Zhejiang, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《浙江农林大学学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《浙江农林大学学报》下载全文 |
|
