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尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因的克隆、表达及多态性分析
引用本文:周芬娜,董忠典,李同明,傅 咏,王 慧. 尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因的克隆、表达及多态性分析[J]. 水产学报, 2012, 36(8): 1167-1178
作者姓名:周芬娜  董忠典  李同明  傅 咏  王 慧
作者单位:山东农业大学动物科技学院,山东泰安,271018
基金项目:中国博士后创新基金项目(20100481295); 山东省自然科学基金(ZR2009DQ021, Y2008D32); 山东省博士后创新基金项目(200703044); 国家重大专项科技计划项目(2001BA804A29)
摘    要:为进一步了解鱼类MHC ⅡA基因的特点及其在免疫反应中的功能,采用同源克隆、RACE-PCR、巢式PCR等技术,从健康的尼罗罗非鱼体获得1 205 bp的MHC ⅡA基因cDNA全序列(Orni-DBA-0101,Genebank登录号:JF719813)及1 388 bp的基因组序列。序列分析发现,尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因含4个外显子和3个内含子,开放阅读框长720 bp,编码239个氨基酸。从4尾尼罗罗非鱼中共得到8条不同的cDNA序列,分别编码不同的氨基酸序列。氨基酸序列比对后发现,序列间存在丰富的多态性,且主要集中在α-1区,多态性位点数远远高于半滑舌鳎MHC ⅡA基因。生物信息学分析表明,尼罗罗非鱼MHC ⅡA编码的蛋白质分子包含1个信号肽、2个胞外结构域、1个跨膜区和1个胞质区,存在4个保守的半胱氨酸残基以及丰富的磷酸化位点,与其他物种的相似性为23%~65%。RT-PCR结果表明,MHC ⅡA基因在脾、肾、肠、鳃、性腺、肝、心脏表达量很高,在鳔和肌肉中表达量最低。人工感染嗜水气单胞菌后,肝、脾、肾、鳃、肠5个组织中MHC ⅡA基因的mRNA水平均发生了不同程度的变化,提示MHC ⅡA分子作为一种重要的免疫因子,在清除病原的免疫反应中起着重要作用。

关 键 词:尼罗罗非鱼  表达  多态性  基因  克隆  MHC
收稿时间:2011-12-25
修稿时间:2012-03-08

Molecular cloning, expression and polymorphism analysis of major histocompatibility complex (MHC) class II A of Nile tilapia (Oreochromis niloticus)
ZHOU Fen-n,DONG Zhong-dian,LI Tong-ming,FU Yong and WANG Hui. Molecular cloning, expression and polymorphism analysis of major histocompatibility complex (MHC) class II A of Nile tilapia (Oreochromis niloticus)[J]. Journal of Fisheries of China, 2012, 36(8): 1167-1178
Authors:ZHOU Fen-n  DONG Zhong-dian  LI Tong-ming  FU Yong  WANG Hui
Affiliation:(College of Animal Science and Technology,Shandong Agricultural University,Tai’an 271018,China)
Abstract:
Keywords:Oreochromis niloticus   expression   polymorphism   gene   cloning   major histocompatibility complex (MHC)
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