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欧李叶片全长cDNA文库的构建和部分克隆的序列分析
引用本文:高小丽,李芳,岳鹏,李天红.欧李叶片全长cDNA文库的构建和部分克隆的序列分析[J].农业生物技术学报,2010,18(1):156-162.
作者姓名:高小丽  李芳  岳鹏  李天红
作者单位:中国农业大学农学与生物技术学院果树系,北京市果树逆境生理与分子生物学重点开放实验室,北京,100193
基金项目:新世纪人才支持计划,国家"十一五"科技支撑计划,国家自然科学基金 
摘    要:采用SMART技术,构建了欧李(Prunus humilis Bunge)品系T8-1叶片全长cDNA文库,原始文库滴度达6.17×10~7 pfu/mL,库容达3.7×10~7,重组率达95%,平均插入片段大小约为1.2 kb.随机挑取400个单克隆进行5'端测序,共获得364个欧李ESTs.绝大部分ESTs的长度在500~1300 bp之间,平均长度为877 bp,其中具有完整ORF结构的序列有221条,占60.71%.通过与NCBI等非冗余核酸数据库和蛋白质数据库进行比对、查询和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因181个(339个ESTs),相似性较低的未鉴定基因5个(9个ESTs),新基因14个(16个ESTs).

关 键 词:欧李  全长cDNA文库

Construction and Sequence Analysis of Partial Clones of a Full-Length cDNA LibraryofChinese Dwarf CherryLeaves
Gao Xiaoli Li Fang Yue Peng Li Tianhong.Construction and Sequence Analysis of Partial Clones of a Full-Length cDNA LibraryofChinese Dwarf CherryLeaves[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2010,18(1):156-162.
Authors:Gao Xiaoli Li Fang Yue Peng Li Tianhong
Institution:Gao Xiaoli Li Fang Yue Peng Li Tianhong * Department of Pomology,College of Agronomy , Biotechnology,China Agricultural University,Key Laboratory of Stress Physiology , Molecular Biology for Tree Fruits of Beijing,Beijing,100193
Abstract:
Keywords:ESTs  Chinese dwarf cherry  Full-length cDNA library  ESTs
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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