木薯SR45亚家族基因鉴定及表达

目的 精氨酸和丝氨酸富集蛋白(Arginine/serine-rich proteins，SR)为剪接复合体的主要成员，不仅参与植物前体mRNA可变剪接过程，在植物非生物胁迫中也具有相当重要的作用。SR45基因为SR基因亚家族成员之一。本研究旨在分析木薯SR45亚家族成员蛋白结构特征与表达模式，为进一步了解该亚家族基因在木薯中的功能提供理论支持。方法 利用生物信息学技术重新构建木薯SR基因家族进化树，对木薯SR45亚家族蛋白理化性质、基因结构、保守结构域进行分析，同时利用转录组数据分析低温与干旱胁迫下SR基因表达变化，运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)研究各基因成员在不同组织中的特异性表达以及对低温胁迫的响应。结果 木薯SR基因家族共7个大类26个成员，SR45亚家族共有5个成员；SR45亚家族基因编码蛋白长度为135~423 aa，相对分子质量为14970~47210，等电点为5.19~12.34；预测其主要定位于细胞核和叶绿体；SR45编码RS结构域和RRM结构域，具有Motif 3、Motif 6、Motif 2和Motif 1保守基序。转录组数据和RT-qPCR分析表明，SR45基因均响应木薯低温胁迫，且MeSR45-2显著上调表达，MeSR45-4、MeSR45-5在木薯根和叶中有较高表达量。结论 木薯SR45亚家族基因显著响应低温胁迫；将MeSR45-2基因列为调控低温逆境变化的候选基因，将根和叶列为研究SR45基因亚类成员的主要组织。本研究为探索木薯SR45基因奠定了理论基础，并为进一步研究木薯SR45基因逆境胁迫应答过程指明了方向。

Identification and expression of SR45 subfamily gene in Manihot esculenta