| 甜瓜叶绿素含量全基因组关联分析及候选基因预测 |
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| 引用本文： | 曹磊,毛文文,梁晓雪,李翔,王盼乔,侯娟,李琼,胡建斌.甜瓜叶绿素含量全基因组关联分析及候选基因预测[J].河南农业大学学报,2023(2):231-240. |
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| 作者姓名： | 曹磊 毛文文 梁晓雪 李翔 王盼乔 侯娟 李琼 胡建斌 |
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| 作者单位： | 河南农业大学园艺学院 |
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| 基金项目： | 河南省重大科技专项项目(221100110400)；;国家自然科学基金项目(31872101,32072564)；;河南省自然科学基金杰出青年科学基金项目(222300420009)； |
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| 摘 要： | 【目的】挖掘与叶绿素含量显著关联的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点和候选基因，为甜瓜叶绿素含量改良提供分子靶点和基因资源。【方法】以118份具有广泛变异的甜瓜种质为自然群体，采用2 531 449个高质量SNP标记对叶片叶绿素含量进行全基因组关联分析，挖掘优异等位变异，并预测候选基因。【结果】甜瓜自然群体叶绿素含量趋向正态分布，包含5个明显的亚群。利用Q模型对2次试验的叶绿素含量及其最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction, BLUP)值进行关联分析，共检测到15个显著位点，分布在甜瓜第1、2、4、8、11、12号染色体上，表型贡献解释率为5.62%～6.69%。其中，8个位点的不同基因型之间存在显著表型差异。结合关联位点的候选区域和转录组数据，共鉴定到28个差异表达基因，其中MELO3C018513.2和MELO3C003666.2是改良甜瓜叶绿素含量的潜在候选基因。【结论】通过高质量SNP标记Q模型的全基因组关联分析，共检测到15个与叶绿素含量显著关联的位点，筛选出2个可能与叶绿素含...
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| 关 键 词： | 甜瓜 叶绿素含量 全基因组关联分析 候选基因 |
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