基于网络药理学和分子对接探讨苦参碱在奶牛生产中的抗炎作用机制 |
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引用本文: | 赵梓轩,杨嘉睿,蒋林树,童津津.基于网络药理学和分子对接探讨苦参碱在奶牛生产中的抗炎作用机制[J].动物营养学报,2022(12):7872-7885. |
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作者姓名: | 赵梓轩 杨嘉睿 蒋林树 童津津 |
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作者单位: | 北京农学院动物科学技术学院奶牛营养学北京市重点实验室 |
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基金项目: | 北京市现代农业产业技术体系奶牛创新团队; |
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摘 要: | 本研究旨在应用网络药理学和分子对接技术探讨苦参碱在奶牛生产中的抗炎作用机制。登录中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库查找苦参碱的主要靶点,再登录PubChem以及PharmMapper数据库对苦参碱靶点进行补充,同时检索GeneCards和DisGeNET数据库获得炎症相关靶点,获取苦参碱与炎症交集靶点即为苦参碱治疗奶牛炎症的候选靶点;通过STRING数据库输入苦参碱抗炎交集靶点并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.9.1软件中的CytoNCA模块筛选该网络核心靶点,利用David数据库对苦参碱抗炎靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Autodock Tools软件对核心靶点以及活性成分进行分子对接。结果表明,苦参碱发挥抗炎作用的相关靶点有71个;PPI网络分析结果发现白蛋白(ALB)、肿瘤坏死因子(TNF)、MYC原癌基因碱性螺旋-环-螺旋转录因子(MYC)、半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、周期蛋白D1(CCND1)、CD44和白细胞介素-6(IL-6)是苦参碱抗炎作用的核心靶点...
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关 键 词: | 苦参碱 网络药理学 炎症 信号通路 奶牛 |
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