越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究 |
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引用本文: | 方茜,张园园,杨钰婷,黄苗苗,符巧丽,周慧莎,陈文荣,宗宇,郭卫东.越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究[J].园艺学报,2018,45(7):1359-1370. |
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作者姓名: | 方茜 张园园 杨钰婷 黄苗苗 符巧丽 周慧莎 陈文荣 宗宇 郭卫东 |
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作者单位: | (浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室,浙江师范大学化学与生命科学学院,浙江金华 321004) |
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摘 要: | 对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70%),三核苷酸次之(21.45%)。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11(VcSSR19),最小值为1.41(VcSSR41),平均值为3.90。香农多样性指数变化范围是0.64 ~ 2.31,平均值为1.55。观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050 ~ 0.900和0.293 ~ 0.870,平均值分别为0.457和0.677。使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份。南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质。
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关 键 词: | 越橘 转录组 SSR 亲缘关系 多态性 |
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