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菠萝R2R3-MYB基因家族S20亚族的鉴定
引用本文:贺 涵,刘传和,邵雪花,等. 菠萝R2R3-MYB基因家族S20亚族的鉴定[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2022, 50(12): 117-127
作者姓名:贺 涵  刘传和  邵雪花  
作者单位:广东省农业科学院 果树研究所,农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室
基金项目:国家重点研发计划项目(2019YFD1001100);国家自然科学基金青年基金项目(32002018);广东省现代农业产业技术体系创新团队建设专项(2021KJ109);广东省农业科学院院长基金项目(202029)
摘    要:【目的】鉴定菠萝R2R3-MYB基因家族S20亚族成员,分析其进化、结构与表达模式,为菠萝S20亚族的生物学功能研究奠定基础。【方法】以菠萝基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对菠萝S20亚族基因进行鉴定,并对其系统进化、结构、保守基序和表达模式进行系统分析。同时,克隆并原核表达代表性基因AcMYB108a,利用Western blot进行杂交验证。【结果】在菠萝基因组上共鉴定到5个S20亚族基因,分布于5条染色体上。系统进化与保守基序分析发现,不同植物的S20蛋白具有较高的保守性且均具有motif3保守基序。顺式作用元件分析表明,菠萝S20亚族基因与植物逆境胁迫响应过程有关,且受乙烯诱导。基因表达分析结果显示,S20亚族基因的表达存在组织特异性,其中AcMYB108a在果实中的表达水平最高。利用pET原核表达系统成功表达了AcMYB108a重组蛋白,并通过了Western杂交验证。【结论】菠萝S20亚族基因与逆境胁迫响应相关,且受到乙烯诱导。

关 键 词:菠萝;MYB基因;S20亚族基因;原核表达;生物信息学
收稿时间:2021-12-09

Identification of S20 subgroup of R2R3-MYB superfamily of Ananas comosus L. Merr.
HE Han,LIU Chuanhe,SHAO Xuehu,et al. Identification of S20 subgroup of R2R3-MYB superfamily of Ananas comosus L. Merr.[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2022, 50(12): 117-127
Authors:HE Han  LIU Chuanhe  SHAO Xuehu  et al
Abstract:
Keywords:Ananas comosus L.Merr.  MYB genes  S20 subgroup genes  prokaryotic expression  bioinformatic
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