长白山区人参根际土壤微生物多样性分析

用PCR-DGGE方法,分析长白山区人参根际土壤微生物的群落结构及多样性。以三年生、五年生的人参根际土壤及无参地土壤为材料,对PCR反应条件、DGGE中凝胶单体、变性剂浓度进行了优化,并对真菌3套引物进行了对比分析,得出细菌16S rDNA V3区引物314F-GC/518R、8%凝胶单体、60%~40%变性剂DGGE分离效果较好;真菌ITS区引物,12%凝胶单体、60%变性剂,6%凝胶单体、40%变性剂搭配效果最佳。用该反应体系扩增出来的PCR产物,在DGGE凝胶上能够清晰地分辨出人参根际土壤细菌和真菌的多样性,由此分析出细菌、真菌的群落结构都存在明显差异。此方法简便快捷,为进一步研究人参根际土壤微生物奠定了基础。