北沙柳株型候选基因表达量与株型相关性的验证

目的]构建北沙柳株型MAS体系实现高效定向育种。方法]以不同株型北沙柳作为研究材料，构建预测群体、训练群体及验证群体。采用RNA-seq与RT-qPCR分析相结合的方法，以测序结果中FPKM值与北沙柳冠高比的相关系数作为预测值，并在大群体和不同时间采样群体中进行验证，最后通过基因组合法筛选与株型相关的最佳基因组合，探讨了北沙柳株型候选基因挖掘技术。结果]冠高比是体现株型性状较理想的特征值。RNA-seq结果中不同基因的预测值不同，预测值的变化范围是0.0～0.9。目标基因（选择已验证与分枝有关SpsLAZY1b、SpsTAC2基因，与调控株型有关的差异基因ZFP4、TB1、SPA2、ABF2、PYL1以及预测值较大的ATX1、FHY1、RFK1基因作为目标基因）表达量与冠高比的相关性在预测群体、训练群体以及验证群体中具有相同的变化趋势，且ATX1、FHY1、RFK1在训练群体和验证群体中相关系数较高。按照“基因个数最少，相关系数最高”的原则，选择（ATX1+FHY1）为鉴别北沙柳株型的最佳基因组合。结论]可利用RNA-seq结果筛选北沙柳株型候选基因，基因表达量与目标性状相关系...