猪血液免疫性状的复合基因组选择研究 |
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作者姓名: | 张巧霞 刘飞 张玲妮 刘向东 赵书红 朱猛进 |
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作者单位: | 1. 华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北 武汉,430070;2. 华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北 武汉 430070; 生猪健康养殖协同创新中心,湖北 武汉 430070 |
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基金项目: | 本研究受国家自然科学基金(31372302、31361140365)和湖北省公益性科技研究项目(2012DBA25001)资助 |
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摘 要: | 该研究在提出“复合基因组选择(composite genomic selection)”概念的基础上,利用华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室构建的免疫资源群体数据,通过交叉验证(cross-validation)策略,与标准GBLUP法对照,利用白细胞(WBC)、噬中性粒细胞(NE)等13项血液免疫性状对复合基因组选择的预测效果开展验证。研究结果表明,除血小板(PLT)等3个性状外,所有性状复合基因组选择的准确性均高于标准GBLUP法,分析结果支持复合基因组选择优于基于单一加性遗传组分的GBLUP的结论。同时,还探讨了不同交叉验证参数组合对复合基因组选择准确性的影响,发现最宜交叉验证倍数是性状特异性的,跟性状特性有关。总之,该研究提出了基于全部遗传组分的复合基因组选择法,并得到猪血液免疫性状数据分析结果的初步支持,特别是针对较小规模群体,复合基因组选择可能是提高基因组预测准确性的有效方法。
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关 键 词: | 猪 免疫性状 复合基因组选择 交叉验证 准确性 |
收稿时间: | 2016-08-03 |
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