| 大豆GmABCG40基因的功能预测及表达分析 |
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| 引用本文： | 李悦,张宇航,李冬梅,王涛,陈薇,王珣,李永光,李文滨. 大豆GmABCG40基因的功能预测及表达分析[J]. 大豆科学, 2017, 36(4). DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2017.04.0502 |
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| 作者姓名： | 李悦 张宇航 李冬梅 王涛 陈薇 王珣 李永光 李文滨 |
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| 作者单位： | 1. 东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨,150030;2. 黑龙江省农业科学院生物技术研究所,黑龙江哈尔滨,150030 |
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| 基金项目： | 黑龙江普通本科高等学校青年创新人才培养计划，抗逆转基因大豆新品培育 |
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| 摘 要： | 通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥At ABCG40在大豆中的同源基因,获得了Gm ABCG40基因序列。通过对Gm ABCG40基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:Gm ABCG40基因CDS序列全长4 284 bp,编码1 427个氨基酸。Gm ABCG40编码的蛋白为疏水性蛋白,具有多个N-糖基化位点、激酶磷酸化位点、N-豆蔻酰化位点、2个ATP/GTP结合位点基序A和1个速激肽家族信号。结构域分析表明Gm ABCG40含有2个核苷酸结合域与2个跨膜结构域,形成NBD1-TMD1-NBD2-TMD2结构,属于ABCG亚家族的成员。Gm ABCG40预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、胚乳表达和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析表明Gm ABCG40与菜豆、红豆、木豆、百脉根等豆科植物亲缘关系较近。组织特异性表达分析结果显示Gm DABCG40在叶片中表达量最低,在根中表达量最高,推测其可能参与根中ABA的转运过程。
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| 关 键 词： | 大豆 ABCG转运蛋白 表达分析 功能 生物信息学 |
Functional Prediction and Expression Analysis of GmABCG40 |
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| LI Yue,ZHANG Yu-hang,LI Dong-mei,WANG Tao,CHEN Wei,WANG Xun,LI Yong-guang,LI Wen-bin. Functional Prediction and Expression Analysis of GmABCG40[J]. Soybean Science, 2017, 36(4). DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2017.04.0502 |
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| Authors: | LI Yue ZHANG Yu-hang LI Dong-mei WANG Tao CHEN Wei WANG Xun LI Yong-guang LI Wen-bin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Soybean ABCG transporters Expression analysis Function Bioinformatics |
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