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水稻地方品种群体内的遗传多样性分析
引用本文:孙建昌,曹桂兰,李亚非. 水稻地方品种群体内的遗传多样性分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2011, 39(12): 145-152
作者姓名:孙建昌  曹桂兰  李亚非
作者单位:西北农林科技大学 农学院;中国农业科学院 作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室;宁夏农林科学院 农作物研究所;中国农业科学院 作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室;中国农业科学院 作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室
基金项目:国家“十一五”科技支撑计划项目(2006BAD13B01);农业部作物种质资源保护项目(NB09-2130135-1-1)
摘    要:【目的】研究水稻地方品种群体内的遗传多样性,为水稻地方品种的有效保护和利用提供理论依据。【方法】以来自云南省不同地区的齐头谷、大白糯、香谷、九月糯、接骨糯、冷水谷、黄版所、麻线谷等8个水稻地方品种为试验材料,分析7个主要农艺性状在群体内的表型变异,利用11对SSR引物进行水稻地方品种群体内的遗传多样性分析。【结果】在7个主要农艺性状中,穗抽出度、有效穗数和穗粒数在地方品种群体内的变异系数较大,分别为37.5%~950.1%,32.0%~49.4%和17.8%~37.5%,而剑叶宽和株高在地方品种群体内的变异系数较小,分别为8.2%~13.7%和4.5%~14.3%。8个水稻地方品种各群体内等位基因数的变幅为27~55个,每个位点的平均等位基因数为2.45~5.00个;稀有等位基因(基因频率小于5%)比率除麻线谷较小(26.0%)外,其余地方品种均较大,为43.2%~69.0%;平均Nei基因多样性指数变异在0.108 3~0.534 2,平均为0.281 3,在各地方品种间表现出极显著差异。AMOVA分析表明,地方品种群体间的变异率为65.9%,而群体内的变异率为34.1%;11对SSR引物中,RM333、RM257和RM180在各群体内既表现出较多的等位基因数(Na),分别为7.50,5.63和4.50个;又表现出较高的Nei基因多样性指数(He),分别为0.503 6,0.413 9和0.350 3。【结论】穗抽出度、有效穗数和穗粒数在地方品种群体内的表型多样性较高,而剑叶宽和株高在地方品种群体内的表型多样性较低。水稻地方品种群体内具有较高的遗传多样性,且在地方品种间表现出显著差异;AMOVA对水稻地方品种群体的遗传变异分析表明,有1/3的差异来源于群体内;RM333、RM257、RM180适合用于云南水稻地方品种群体内的遗传多样性检测。

关 键 词:水稻  地方品种  SSR  遗传多样性
收稿时间:2011-05-30

Analysis of genetic diversity within populations of rice(Oryza sativa L.) landraces
SUN Jian-chang,CAO Gui-lan,LI Ya-fei,MA Jing,CHEN Yao-feng,HAN Long-zhi. Analysis of genetic diversity within populations of rice(Oryza sativa L.) landraces[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2011, 39(12): 145-152
Authors:SUN Jian-chang  CAO Gui-lan  LI Ya-fei  MA Jing  CHEN Yao-feng  HAN Long-zhi
Affiliation:SUN Jian-chang1,2,3,CAO Gui-lan2,LI Ya-fei2,MA Jing3,CHEN Yao-feng1,HAN Long-zhi2(1 College of Agronomy,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China,2 Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Crop Germplasm Resources and Utilization,Ministry of Agriculture/The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement,Beijing 100081,3 Institution of Crop Research,Ningxia Academy of Agricultural Sciences,Yongning,Ningxia 750105,China...
Abstract:
Keywords:rice (Oryza sativa L.)  landrace  SSR  genetic diversity
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