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蓖麻WRKY转录因子的全基因组鉴定及其进化分析
引用本文:邹智.蓖麻WRKY转录因子的全基因组鉴定及其进化分析[J].中国油料作物学报,2013,35(1):36-42.
作者姓名:邹智
作者单位:中国热带农业科学院橡胶研究所,农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室
基金项目:国家自然科学资金(31100460);海南省重点科技项目(90107);海南省自然科学基金(312026);中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(1630022011014)
摘    要: 为探讨WRKY转录因子在蓖麻耐胁迫中可能的生物学功能,研究基于已公布的基因组和ESTs数据对蓖麻WRKY转录因子家族进行全面鉴定和系统命名,并在此基础上分析了其基因结构和进化特征。结果显示,蓖麻基因组中至少存在56个WRKY基因,它们散布于39条scaffolds上,所含内含子数目在1-5个;RcWRKYs包含1~2个WRKY结构域,根据WRKY结构域的数量及其锌指结构的特征,这些蛋白可分为I、IIa、IIb、IIc、IId、IIe 和III类/亚类。与拟南芥相比,蓖麻的WRKY基因在物种分化后并未明显进化,它们中的大部分在拟南芥中都有同源基因;相对而言,在不同类基因中,I类的WRKY基因得到了较快的进化。  

关 键 词:蓖麻  全基因组  WRKY转录因子  进化分析
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