| 微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用 |
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| 引用本文： | 何小燕,白俊杰,刘小林. 微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2009, 37(8): 55-62 |
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| 作者姓名： | 何小燕 白俊杰 刘小林 |
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| 作者单位： | 何小燕(西北农林科技大学,动物科技学院,陕西,杨凌,712100;中国水产科学研究院,珠江水产研究所,热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380);白俊杰,何小平,李胜杰,叶星(中国水产科学研究院,珠江水产研究所,热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380);刘小林(西北农林科技大学,动物科技学院,陕西,杨凌,712100);樊佳佳(中国水产科学研究院,珠江水产研究所,热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380;大连水产学院,生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023) |
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| 基金项目： | 国家科技支撑项目，国家科技基础条件平台工作项目，广东省科技计划项目 |
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| 摘 要： | 【目的】探讨微卫星DNA标记在大口黑鲈(Micropterus salmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据。【方法】选择12个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。【结果】所选的12个微卫星DNA多态位点在102个子代中的平均等位基因数(A)为3,平均观测杂合度(Ho)为0.594 8,平均期望杂合度(He)为0.545 7,平均多态信息含量(PIC)为0.475 9。Cervus3.0亲权分析表明,在置信度为95%时,使用12个和10个位点,模拟和实际分析的判别成功率分别为96%和98%,87%和91%;而置信度为99%时,分别为78%和92%,64%和86%;在置信度为99%和95%时,判别准确率皆在90%以上。从12个位点中挑选10个多态信息含量高的微卫星DNA位点,即可将102个子代完全准确地聚为5个群体。亲权分析结果与聚类分析结果一致。【结论】所选用的12个微卫星位点可用于大口黑鲈亲权鉴定研究,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。
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| 关 键 词： | 微卫星 大口黑鲈(Micropterussalmodies) 亲权分析 聚类分析 |
| 收稿时间： | 2008-11-17 |
Application of microsatellite makers for parentage determination in Micropterus salmoides |
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| HE Xiao-yan,BAI Jun-jie,LIU Xiao-lin,FAN Jia-jia,HE Xiao-ping,LI Sheng-jie,YE Xing. Application of microsatellite makers for parentage determination in Micropterus salmoides[J]. Journal of Northwest A&F University（Natural Science Edition）, 2009, 37(8): 55-62 |
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| Authors: | HE Xiao-yan BAI Jun-jie LIU Xiao-lin FAN Jia-jia HE Xiao-ping LI Sheng-jie YE Xing |
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| Affiliation: | 1 College of Animal Science and Technology,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 Key Lab of Tropical & Subtropical Fish Breeding & Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou,Guangdong 510380,China;3 College of Life Science and Technology,Dalian Fisheries University,Dalian,Liaoning 116023,China) |
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| Abstract: | |
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