| 芒果转录组中SSR位点信息分析与引物筛选 |
| |
| 引用本文： | 罗纯,武红霞,姚全胜,王松标,许文天,马小卫.芒果转录组中SSR位点信息分析与引物筛选[J].热带作物学报,2015,36(7):1261-1266. |
| |
| 作者姓名： | 罗纯 武红霞 姚全胜 王松标 许文天 马小卫 |
| |
| 作者单位： | 农业部热带果树生物学重点实验室中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 |
| |
| 基金项目： | 农业行业科研专项（No. 201203092-3）；中央级公益性科研院所基本科研业务费（No. 1630062014008，No. 1630062013003）；“广东省自然科学基金-博士启动（No. 2014A030310341）”和“海南省自然科学基金（No.20153044）”。 |
| |
| 摘 要： | 利用MicroSAtellite软件分析筛选芒果转录组中的SSR位点。结果表明，在54 207条Unigene中共搜索得到4 103个SSR位点，出现频率为7.57％。其中，三核苷酸重复为主导重复类型，占SSR总数的38.19％，其次是单核苷酸重复（26.91％）。AG/CT和AAG/CTT分别是二核苷酸和三核苷酸重复的优势基元。根据SSR侧翼序列共设计6 915对SSR引物，随机挑选了230对进行PCR检测，获得93对多态性引物。由此可见，芒果转录组数据可以作为大量开发SSR标记的资源，这些SSR标记也将有助于芒果遗传多样性和种质资源鉴定的研究。
|
| 关 键 词： | 芒果 转录组 SSR信息 多态性 |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《热带作物学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《热带作物学报》下载免费的PDF全文 |
|
