东北虎γ-干扰素基因的克隆、生物信息学分析及其在毕赤酵母中的表达 |
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引用本文: | 翟俊琼,吴亚江,代军威,陈安妮,周妞,王晨,杜雪晴,罗满林,陈武.东北虎γ-干扰素基因的克隆、生物信息学分析及其在毕赤酵母中的表达[J].中国畜牧兽医,2021,48(1):72-82. |
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作者姓名: | 翟俊琼 吴亚江 代军威 陈安妮 周妞 王晨 杜雪晴 罗满林 陈武 |
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作者单位: | 1. 广州动物园, 广州市野生动物研究中心, 广州 510070;2. 华南农业大学兽医学院, 广州 510642 |
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基金项目: | 濒危野生动物调查监管与行业规范项目(20190921) |
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摘 要: | 本试验旨在通过克隆东北虎γ-干扰素(IFN-γ)基因,研究其分子特征并预测蛋白生物学功能,为后续研究干扰素抗病毒活性做前期准备。通过RT-PCR从ConA诱导过的东北虎血淋巴细胞中扩增东北虎IFN-γ基因并测序,应用生物信息学方法进行序列分析。结果表明:东北虎IFN-γ编码区由504个核苷酸组成,共编码167个氨基酸,蛋白相对分子质量为19.59 ku,等电点为9.03,所编码的蛋白为碱性亲水性蛋白,其中前23个氨基酸可能为信号肽,IFN-γ编码蛋白保守结构域为IFN-γ超家族,且存在跨膜结构,其中1-6位氨基酸为胞内区域,7-28位氨基酸为跨膜区域,29-167位氨基酸为胞外区域;IFN-γ编码蛋白二级结构主要以α-螺旋(58.08%)和无规则卷曲(33.53%)为主,存在5个潜在的B细胞抗原表位,3个潜在的N-糖基化位点;分子进化分析显示,东北虎IFN-γ与GenBank上发表的东北虎、非洲狮、金钱豹、美洲狮、猎豹、家猫、加拿大猞猁、野猪等的核苷酸相似性为80.4%~99.8%,氨基酸相似性为70.5%~100%,东北虎IFN-γ与非洲狮、金钱豹亲缘关系最近,美洲狮、猎豹、家猫、猞猁次之,野猪最远。通过合成改造后的东北虎IFN-γ基因,构建能表达IFN-γ蛋白的重组质粒pPIC9K-IFN-γ,将其导入高效表达系统-毕赤酵母中进行诱导表达,经SDS-PAGE分析,表达蛋白的分子量约17.8 ku,与预期大小相符,表明东北虎IFN-γ成功表达。
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关 键 词: | 东北虎 γ-干扰素(IFN-γ) 基因克隆 生物信息学 毕赤酵母 |
收稿时间: | 2020-05-18 |
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