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荷花SRAP-PCR反应体系的优化与确立
引用本文:孙祖霞,刘兆磊,陈素梅,陈发棣,楼望淮,郭海林. 荷花SRAP-PCR反应体系的优化与确立[J]. 南京农业大学学报, 2011, 34(6)
作者姓名:孙祖霞  刘兆磊  陈素梅  陈发棣  楼望淮  郭海林
作者单位:1. 南京农业大学园艺学院,江苏南京,210095
2. 南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京210014
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项
摘    要:以荷花(Nelumbo nucifera Gaertn)品种‘新红’叶片为材料,采用L16(45)正交试验设计,对SRAP-PCR反应体系中的Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物和模板DNA用量5因素进行了优化,并确立了适用于荷花SRAP-PCR的最佳反应体系.结果表明:荷花的SRAP-PCR最佳反应体系为:反应总体积10 μL,包含2.0 mmol ·L-1Mg2+、300 μmol·L-1dNTPs、0.5UTaqDNA聚合酶、4μmol·L-1上下游引物、50 ng DNA及10×PCR Buffer.各因素水平变化对反应体系影响由大到小依次为:TaqDNA聚合酶、Mg2+、引物、dNTPs、DNA.用48个荷花品种对优化的SRAP-PCR反应体系进行验证,均获得了条带清晰、多态性丰富的扩增图谱,证实了该体系的稳定性和适应性.

关 键 词:荷花  SRAP-PCR  正交试验设计  反应体系优化

Optimization and establishment of SRAP-PCR reaction system for Nelumbo nucifera Gaertn
SUN Zu-xia,LIU Zhao-lei,CHEN Su-mei,CHEN Fa-di,LOU Wang-huai,GUO Hai-lin. Optimization and establishment of SRAP-PCR reaction system for Nelumbo nucifera Gaertn[J]. Journal of Nanjing Agricultural University, 2011, 34(6)
Authors:SUN Zu-xia  LIU Zhao-lei  CHEN Su-mei  CHEN Fa-di  LOU Wang-huai  GUO Hai-lin
Abstract:
Keywords:
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