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罗非鱼海豚链球菌16srRNA基因的序列测定和系统进化分析
引用本文:甘西,陈明,余晓丽,李莉萍,陈汉忠,徐增辉,雷爱莹,梁万文,黄维义.罗非鱼海豚链球菌16srRNA基因的序列测定和系统进化分析[J].广西水产科技,2006(4):8-14.
作者姓名:甘西  陈明  余晓丽  李莉萍  陈汉忠  徐增辉  雷爱莹  梁万文  黄维义
作者单位:[1]广西水产研究所,广西南宁530021 [2]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005
基金项目:广西科学研究与技术开发计划基金资助项目(0639036)
摘    要:为了从分子水平上对~株来源于发病罗非鱼的链球菌进行分类学鉴定,本研究利用原核生物16srRNA基因通用引物对该菌株进行了16srRNA基因的克隆及序列分析。结果扩增出长约1.5kbp目的片段,测序得到一条长度为1447bp核苷酸序列。核苷酸同源性分析表明,该序列与NCBI公布的海豚链球菌(Streptococcus iniae,s.iniae)SCCF5L菌株16srRNA基因核苷酸序列同源性最高(99.496),暂称为中国广西株(S.iniae-CGX)。同时,亲源关系较近的S.iniae、S.difficile和S,agalaciate代表菌株构建的系统发育进化树显示,该菌株与S.iniae代表菌株组成同一进化分支,与s.agalaciate代表菌株组成的另一进化分支距离较近(95.596),而与S.difficile代表菌株组成的进化分支距离较远(92.3%)。本研究证实,从发病罗非鱼脑组织分离得到的致病性链球菌为海豚链球菌。

关 键 词:罗非鱼  海豚链球菌  16s  rRNA  克隆  系统发育进化树
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