| 从中国对虾ESTs中筛选微卫星标记的研究 |
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| 作者姓名： | 徐鹏 |
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| 作者单位： | 中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071;中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071;中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071;中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展项目 (G1 9990 1 2 0 0 7),国家自然科学基金项目 (3 991 0 1 1 3 ),国家高技术研究发展计划(2 0 0 1AA6 2 1 0 50 ) |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法在含有10446个中国对虾ESTs的数据库中进行微卫星序列的筛选,共发现微卫星序列229个,占整个ESTs数据库的2．19％,其中含双碱基重复序列146个和3碱基重复序列58个,分别占在ESTs数据库中发现微卫星序列总数的63．76％,和25．33％,大部分发现的微卫星序列均为Perfect形式的重复序列。根据筛选得到的微卫星序列设计并合成引物19对进行多态性检测,在有扩增产物的16对引物中,首次筛选得到8个中国对虾微卫星标记,并对这些微卫星标记进行了等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度、PIC值等统计学指标的评价。结果表明,在8个微卫星位点上,等位基因的数目从5到15不等,等位基因长度从：165～305bp,期望杂合度和多态性信息含量分别为0．59到0．89和0．56到0．88,表明这8个中国对虾微卫星标记完全适合于遗传分析。
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| 关 键 词： | 中国对虾 表达序列标签 微卫星 |
| 文章编号： | 1000-0615(2003)03-0213-06 |
| 收稿时间： | 2014-03-18 |
| 修稿时间： | 2002-09-24 |
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