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6株猪O型口蹄疫病毒VP1基因的克隆与序列分析
引用本文:娄高明,张晋川,张念祖.6株猪O型口蹄疫病毒VP1基因的克隆与序列分析[J].中国预防兽医学报,2006,28(1):72-76.
作者姓名:娄高明  张晋川  张念祖
作者单位:1. 韶关学院英东生物工程学院,广东,韶关,512005
2. 云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南,昆明,650224
基金项目:广东省科技攻关项目;广东省韶关市科技计划;香港铭源基金
摘    要:根据口蹄疫病毒(FMDV)VP1基因的序列,设计并合成了2对用于扩增VP1基因的引物。从组织中提取总RNA,首先用P1、P2引物对6株猪。型口蹄疫病毒进行RT—PCR扩增,获得1000bp的片段;再用P3、P4引物进行巢式PCR扩增,结果获得850bp的片段。将850bp的片段克隆到pMD18—-T载体中,通过PCR鉴定,将阳性重组质粒进行测序并分析。结果发现6株FMDV的核苷酸同源性为80.2%~99.4%,其推导的氨基酸序列同源性为86.9%~99.5%;构建遗传发生树,发现6株FMDV属于两个不同的基因型,其中的Shunde00、Sihui01、Shenzhen99、Fushan01株属一个基因型(与Hongkong93、广东86分离株属同一基因型);Guangzhou99、Shenzhen00株属另一个基因型(与UKG-12—2001株、JPN2000株属同一基因型)。通过对口蹄疫病毒VP1基因的测序与分析,了解其变异情况,为科学地防控FMD提供分子水平的依据。

关 键 词:口蹄疫病毒  VP1基因  遗传发生树  克隆  序列分析
文章编号:1008-0589(2006)01-0072-05

Cloning and sequence analysis of the VP1 gene of Guangdong derived strains of foot-and-mouth disease virus type O in swine
LOU Gao-ming,ZHANG Jin-chuan,ZHANG Nian-zu.Cloning and sequence analysis of the VP1 gene of Guangdong derived strains of foot-and-mouth disease virus type O in swine[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2006,28(1):72-76.
Authors:LOU Gao-ming  ZHANG Jin-chuan  ZHANG Nian-zu
Abstract:
Keywords:Foot-and-mouth Disease Virus  VP1 gene  phylogenetic tree  cloning  sequencing
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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