河南3个驴种mtDNA D-loop区序列多态性及起源进化分析 |
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引用本文: | 郑 立,刘延鑫,赵绪永. 河南3个驴种mtDNA D-loop区序列多态性及起源进化分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2011, 39(3): 29-34 |
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作者姓名: | 郑 立 刘延鑫 赵绪永 |
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作者单位: | 郑州牧业工程高等专科学校;河南中医学院;郑州牧业工程高等专科学校 |
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基金项目: | 河南省重大科技攻关项目(092101110100);郑州牧专博士科研启动基金项目(200901008) |
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摘 要: | 【目的】研究河南3个驴种(河南小毛驴、长垣驴、泌阳驴)的遗传多样性及其系统发育关系。【方法】采用PCR和测序技术,测定15头长垣驴、20头泌阳驴和14头河南小毛驴共49个个体的mtDNA D-loop区部分序列,采用DNAsp 4.90进行多态性分析,并利用MEGA4.1的邻接(NJ)法构建系统发育树。【结果】长垣驴、泌阳驴和河南小毛驴3个驴种共49个样本的PCR扩增产物长度均为444 bp,mtDNA D-loop区的核苷酸多样度分别为2.295%,2.163%和2.799%;单倍型多样度结果分别为0.879,0.629和0.956,表明3个驴品种mtDNA D-loop区均具有较高的多态性,其中河南小毛驴最高,长垣驴和泌阳驴次之;构建的NJ系统发育树表明,河南省3个驴种属于混合起源,泌阳驴与长垣驴亲缘关系较远,而与河南小毛驴的亲缘关系较近。【结论】河南省3个驴种具有较丰富的遗传多样性,河南省家驴属于混合母系起源。
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关 键 词: | 驴;线粒体DNA;D-loop区 |
Analysis of phylogenetic relationship and genetic diversity of mtDNA D-loop in three Henan donkey breeds |
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Abstract: | |
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Keywords: | donkey mtDNA D-loop |
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