| 五指山小型猪APEX1基因cDNA的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李治深,杜丽,刘涛,申明霞,王凤阳,成鹰,陈品林,林杰材,满初日嘎,祁超. 五指山小型猪APEX1基因cDNA的克隆及生物信息学分析[J]. 安徽农业科学, 2009, 37(30) |
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| 作者姓名： | 李治深 杜丽 刘涛 申明霞 王凤阳 成鹰 陈品林 林杰材 满初日嘎 祁超 |
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| 作者单位： | 湖南大学农学院,海口市动物基因工程重点实验室,海南,海口,570228;湖南大学农学院,海口市动物基因工程重点实验室,海南,海口,570228;华中师范大学生命科学学院,湖北,武汉,430079;华中师范大学生命科学学院,湖北,武汉,430079 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，海南省自然科学基金项目，海南省教育厅高校科研项目 |
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| 摘 要： | [目的]对五指山小型猪脱嘌呤嘧啶核酸内切酶cDNA进行克隆和生物信息学分析。[方法]以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR方法,克隆得到APEX1基因全长cDNA,并运用生物信息学软件对该基因核苷酸序列及其编码蛋白的理化性质及二级结构等进行分析和预测。[结果]生物信息学分析表明,该cDNA全长1392bp,5′非翻译区长132bp,3′非翻译区长303bp,含有一个957bp的完整开放阅读框,编码318个氨基酸。该蛋白的分子量为35kD,等电点为8.05。比对分析表明,五指山小型猪APEX1基因的核酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、黑猩猩等哺乳动物具有较高的相似性。[结论]成功克隆了五指山小型猪A-PEX1基因cDNA,为进一步研究APEX1在动物体内的作用机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 五指山小型猪 脱嘌呤嘧啶核酸内切酶 cDNA文库 克隆 序列分析 |
cDNA Cloning and Bioinformatics Analysis of APEX1 Gene from Wuzhishan Miniature Pig |
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| LI Zhi-shen et al. cDNA Cloning and Bioinformatics Analysis of APEX1 Gene from Wuzhishan Miniature Pig[J]. Journal of Anhui Agricultural Sciences, 2009, 37(30) |
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| Authors: | LI Zhi-shen et al |
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| Affiliation: | LI Zhi-shen et al (College of Agriculture,Hainan University,Animal Genetic Engineering Key Lab.of Haikou,Haikou,Hainan 570228) |
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| Abstract: | [Objective] The study aimed to clone full-length cDNA of APEX1 gene from Wuzhishan miniature pig and bioinformatics analysis be carried out of this gene.[Method] Taking constructed cDNA library of the peripheral blood leucocytes from Wuzhishan miniature pig as material,the full-length cDNA of APEX1 gene was cloned by using colony PCR method.Nucleotide sequence of APEX1 gene,physicochemical properties and secondary structure of its encoding protein were analyzed and predicted by using bioinformatics software... |
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| Keywords: | Wuzhishan miniature pig APEX1 cDNA library Cloning Bioinformatics analysis |
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