利用RNA-Seq技术筛选不同海拔地区山羊转录组SNP |
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作者姓名: | 姚娜 张文广 张兵 赵倩君 左清清 董坤哲 冯爱琴 马月辉 |
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作者单位: | 1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193 2. 内蒙古农业大学动物科学学院 3. 中国科学院北京基因组研究所所级中心 4. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;云南农业大学动物科学技术学院 |
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基金项目: | 国家绒毛用羊产业技术体系 |
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摘 要: | 动物和人类的高海拔环境适应性机制和作用途径一直是生物学、医学和疾病学等领域研究者热衷探讨的课题之一,而从转录组水平对于西藏绒山羊的高海拔环境适应性研究仍未开展.以处于不同海拔地区的西藏班戈绒山羊和辽宁绒山羊为研究对象,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术,对其转录组进行测序,共筛选出153654个班戈绒山羊品种内SNP位点,154815个辽宁绒山羊品种内SNP位点,以及5391个两品种间SNP位点,为从转录组水平对西藏班戈绒山羊高海拔环境适应性研究提供基础数据.
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关 键 词: | RNA-Seq 山羊 转录组 SNP |
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