| 利用高密度 Bin 图谱定位水稻叶绿素含量 QTL |
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| 引用本文： | 潘俊峰,崔克辉,刘彦卓,王昕钰,严博宇,梁开明. 利用高密度 Bin 图谱定位水稻叶绿素含量 QTL[J]. 广东农业科学, 2022, 49(9): 132-140 |
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| 作者姓名： | 潘俊峰 崔克辉 刘彦卓 王昕钰 严博宇 梁开明 |
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| 作者单位： | 1. 广东省农业科学院水稻研究所 / 广东省水稻育种新技术重点实验室 / 广东省水稻工程实验室 /农业农村部华南优质稻遗传育种重点实验室，广东 广州 510640；2. 华中农业大学植物科技学院 / 作物遗传改良国家重点实验室 /农业农村部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室，湖北 武汉 430070 |
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| 基金项目： | 广州市科技计划项目“珠江科技新星”专题（201806010094）；广东省科技计划项目（2021B1212050020） |
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| 摘 要： | 【目的】探索水稻叶绿素含量及其对氮肥响应的遗传机理，为氮高效、高光效的水稻品种培育提供新的标记区段。【方法】以珍汕 97× 明恢 63 重组自交系 RIL（F11）113 个家系为 QTL 分析的试验材料，在大田栽培条件下，以施氮量为主区、家系为裂区，设计低氮处理（不施氮肥）和正常氮处理（纯氮130、135 kg/hm2），分别于水稻移栽后 30 d 测定 1.5 叶的 SPAD 值，于抽穗期测定剑叶的 SPAD 值。利用包含1 619 个 Bin 标记的高密度遗传图谱，使用 IciMapping V3.4 软件和完备区间作图法，定位控制水稻叶片叶绿素含量的 QTL。【结果】在两年、两个氮处理和两个发育时期共检测到 15 个调控叶片叶绿素含量的 QTL，分别分布在第 1、2、3、6、7、10、11 号染色体上。单一 QTL 贡献率为 1.21%~40.74%。通过物理位置比较，发现其中 6个 QTL 已经被克隆或与前人定位到的叶绿素含量相关位点在同一区间。其中，在第 6 染色体的 8.45~9.12 Mb 处定位到 1 个调控抽穗期剑叶叶绿素的位点，命名为 qHDCHL6-1，该位点在两年和两个氮处理下均被检测到，贡献率为 1.55%~28.01%。结合功能注释，共筛选到 4 个与叶绿素代谢密切相关的基因，分别为 LOC_Os06g15370（OsNPF3.1）、LOC_Os06g15420（OsAS2）、LOC_Os06g15620（GAST）和 LOC_Os06g15590，其中前 3 个基因已被鉴定克隆。【结论】共检测到 15 个控制水稻移栽后 30 d 和抽穗期叶片叶绿素含量的 QTL，鉴定了 1 个稳定表达的 QTL 位点 qHDCHL6-1，在该区间筛选到 4 个候选基因。
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| 关 键 词： | 水稻；重组自交系；高密度 Bin 图谱；叶绿素含量；QTL |
Mapping of QTL for Chlorophyll Content in Rice on High-Density Bin Map |
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| PAN Junfeng,CUI Kehui,LIU Yanzhuo,WANG Xinyu,YAN Boyu,LIANG Kaiming. Mapping of QTL for Chlorophyll Content in Rice on High-Density Bin Map[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2022, 49(9): 132-140 |
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| Authors: | PAN Junfeng CUI Kehui LIU Yanzhuo WANG Xinyu YAN Boyu LIANG Kaiming |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rice recombinant inbred line high-density Bin map chlorophyll content QTL |
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