2018〜2019年我国部分地区新城疫病毒的F基因序列分析 |
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引用本文: | 胡秀美,仇微红,梁昭平,钟文婷,叶贺佳,罗开健.2018〜2019年我国部分地区新城疫病毒的F基因序列分析[J].养禽与禽病防治,2021(1). |
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作者姓名: | 胡秀美 仇微红 梁昭平 钟文婷 叶贺佳 罗开健 |
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作者单位: | 广州市华南农大生物药品有限公司;华南农业大学兽医学院 |
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摘 要: | 本研究自2018-2019年从疑似感染新城疫的家禽病料分离鉴定出13株新城疫病毒(Newcastle disease viruses,NDV),采用RT-PCR方法对这13株NDV分离株的F基因进行扩增,产物经TA克隆并测序后与GenBank数据库中的参考毒株进行遗传进化分析。结果显示,其中的7株属于基因Ⅱ型,5株属于基因VI型,1株属于ClassⅠ亚型。F基因相似性分析结果显示,7株基因Ⅱ型毒株与疫苗株La Sota.Bl sClone 30的核昔酸相似性在9&1%-100%之间,氨基酸的相似性在97.6%~100%之间。5株基因VI型分离株与Ⅱ、Ⅶ型疫苗株及VIb亚型代表株之间的核昔酸相似性在79.7%-98.4%之间,氨基酸的相似性在76.6%-97.6%之间。1株基因Ⅰ型的分离株与Ⅱ,Ⅶ型疫苗株及Class Ⅰ代表毒株的核昔酸相似性在52.1%-97.3%之间,氨基酸的相似性在68.5%-96.8%之间,表明当前部分地区的NDV分离株与传统疫苗株之间存在较明显的遗传特征差异。
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关 键 词: | 新城疫病毒 F基因 遗传进化分析 基因相似性 |
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