| 检测猫杯状病毒RT-qPCR方法的优化与应用 |
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| 引用本文： | 刘迪,郑亚婷,许鑫燕,董丽丽,康洪涛,姜骞,杨鸣发,刘家森,曲连东.检测猫杯状病毒RT-qPCR方法的优化与应用[J].中国兽医学报,2022(1). |
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| 作者姓名： | 刘迪 郑亚婷 许鑫燕 董丽丽 康洪涛 姜骞 杨鸣发 刘家森 曲连东 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室;东北农业大学动物医学学院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划资助项目(2019YFC1200701);兽医生物技术国家重点实验室课题资助项目(SKLVBP202104)。 |
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| 摘 要： | 为建立一种通用性良好的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法,根据GenBank上猫杯状病毒(feline calicivirus,FCV)ORF1保守区域序列,设计合成1对特异性引物,用于FCV的快速检测。灵敏性试验结果显示,该方法的检测下限为4.93×10;拷贝/μL,比普通RT-PCR检测下限高100倍;特异性试验结果显示,该检测方法与猫疱疹病毒、猫细小病毒、猫传染性腹膜炎病毒等无交叉反应;通用性试验结果显示,针对引物靶位点区间,该方法对所有已知变异位点的人工合成质粒和本实验室保存的不同变异位点的FCV毒株,均能够良好检出;重复性试验结果显示,组内的变异系数为0.09%~0.71%,组间变异系数为0.05%~0.82%,均小于1%。对23份临床样品进行检测,该方法的阳性检出率为60.9%,检出的14份阳性病料分别接种到CRFK细胞中,对细胞病变产物进行扩增并测序,BLAST对比后结果证实为FCV毒株。结果表明,本试验建立的荧光定量RT-PCR检测方法可用于FCV的快速诊断及流行病学的调查。
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| 关 键 词： | 猫杯状病毒 实时荧光定量RT-PCR SYBR GreenⅠ ORF1 |
Optimization and application of RT-qPCR assay for detection of feline calicivirus |
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| LIU Di,ZHENG Yating,XU Xinyan,DONG Lili,KANG Hongtao,JIANG Qian,YANG Mingfa,LIU Jiasen,QU Liandong.Optimization and application of RT-qPCR assay for detection of feline calicivirus[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2022(1). |
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| Authors: | LIU Di ZHENG Yating XU Xinyan DONG Lili KANG Hongtao JIANG Qian YANG Mingfa LIU Jiasen QU Liandong |
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| Institution: | (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology,Harbin Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150069,China;College of Veterinary Medicine,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | feline calicivirus(FCV) real-time RT-PCR SYBR GreenⅠ ORF1 |
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