猪轮状病毒贵州株NSP4基因克隆及序列分析

为了解猪轮状病毒(PoRV)贵州株NSP4基因的序列特征,试验根据Gen Bank上公布的猪轮状病毒NSP4基因序列设计1对特异性引物,扩增一株猪轮状病毒贵州流行株NSP4基因序列并进行序列测定及分析。结果表明:得到的碱基序列(562 bp)与预期结果相符,包含NSP4基因528 bp的开放阅读框,编码175 aa;与已知的14个国内外参考毒株NSP4核苷酸和推导氨基酸序列比较,同源性分别为89.1%~94.1%和95.4%~98.3%;氨基酸系统进化树结果显示,贵州流行株与国内流行株LL36755亲缘关系较近。说明试验成功克隆了PoRV贵州株NSP4基因,获得了其序列,并分析了其序列特征。