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细粒棘球绦虫TSP8基因在其不同发育阶段的差异表达及生物信息学分析
引用本文:王炜烨,王云菲,陆宝燕,马勋,张艳艳,孟季蒙,王正荣,薄新文. 细粒棘球绦虫TSP8基因在其不同发育阶段的差异表达及生物信息学分析[J]. 中国动物传染病学报, 2022, 0(1): 157-165
作者姓名:王炜烨  王云菲  陆宝燕  马勋  张艳艳  孟季蒙  王正荣  薄新文
作者单位:石河子大学动物科技学院;新疆农垦科学院畜牧兽医研究所省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)(2015CB150300);国家自然科学基金(31860701,31360608);新疆生产建设兵团国际科技合作(2017BC003)。
摘    要:为研究细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus,E.g)TSP8基因的分子特性以及其在虫体不同发育阶段的差异表达,根据NCBI GenBank数据库中的TSP8基因设计1对特异性引物,对TSP8基因进行PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,通过生物信息学软件分析预测TSP8基因的结构与功能,并通过SYBR Green Ⅰ qRT-PCR方法分析TSP8基因在虫体原头蚴、包囊壁以及成虫mRNA相对转录情况。结果显示:成功克隆到细粒棘球绦虫TSP8基因序列,与细粒棘球绦虫跨膜蛋白(GenBank登录号:CDS17460.1)同源性为100%;进一步生物信息学分析显示,TSP8基因全长669个核苷酸,编码222个氨基酸,理论等电点为5.06,为稳定蛋白分子;TSP8基因编码的氨基酸序列共含有5个跨膜区域,含有4个优势B抗原表位;qRT-PCR结果显示TSP8基因在原头蚴及成虫阶段均有表达,差异显著,具有统计学意义(P<0.05)。本研究对细粒棘球绦虫TSP8基因的分子特性进行了初步研究,为进一步揭示其生物学功能奠定了基础。

关 键 词:细粒棘球绦虫  基因克隆  差异表达  生物信息学分析

Differential Expression and Bioinformatics Analysis of TSP8 Gene of Echinococcus granulosus at Different Developmental Stages
WANG WeiYe,WANG YunFei,LU BaoYan,Ma Xun,ZHANG Yanyan,MENG Jimeng,WANG Zhengrong,BO Xinwen. Differential Expression and Bioinformatics Analysis of TSP8 Gene of Echinococcus granulosus at Different Developmental Stages[J]. Chinese Journal of Animal Infectious Diseases, 2022, 0(1): 157-165
Authors:WANG WeiYe  WANG YunFei  LU BaoYan  Ma Xun  ZHANG Yanyan  MENG Jimeng  WANG Zhengrong  BO Xinwen
Affiliation:(College of Animal Science and Technology,Shihezi 832000,China;State Key Laboratory of sheep Genetic Improvement and Healthy Production/Institute of Animal Husbandry and Veterinary,Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Sciences,Shihezi 832000,China)
Abstract:
Keywords:Echinococcus granulosus  gene cloning  differential expression  bioinformatics
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