普通烟草β-胡萝卜素羟化酶2基因克隆与生物信息学分析 |
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作者姓名: | 雷波 丁福章 赵会纳 卢坤 蔡凯 潘文杰 |
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作者单位: | 1. 贵州省烟草科学研究院,贵州 贵阳,550081 2. 西南大学 农学与生物科技学院,重庆 北碚,400715 |
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基金项目: | 贵州省科学技术基金项目“运用iTRAQ技术研究烤烟主要生育期烟叶中蛋白质的相对表达量”[黔科合J 字顾(2013)2195];中国烟草总公司科技重大专项子课题“中间香型特色优质烟叶物质代谢基础研究” |
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摘 要: | β-胡萝卜素羟化酶(beta-carotene hydroxylase,BCH)是植物类胡萝卜素合成代谢中的关键限速酶,为获得烟草β-胡萝卜素羟化酶2(NtBCH2)基因序列,采用同源克隆法从烟草中分离NtBCH2的基因组DNA序列,基因登录号为JX101477。结果表明:1)同源克隆法从烟草中克隆出NtBCH2基因,NtBCH2基因组DNA全长2131bp,cDNA为1 083bp,含7个外显子和6个内含子。2)NtBCH2蛋白有309个氨基酸,分子量为34.79kD,具有7个糖基化位点,11个磷酸化位点,4个跨膜域。3)系统发育树与BLAST分析表明,NtBCH2是番茄的SlBCH和辣椒CaBCH2的同源基因;GENEVESTIGATOR数据库芯片结果表明,NtBCH2在幼嫩的茎和子叶中表达量最高。
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关 键 词: | 烟草 β-胡萝卜素羟化酶2基因 香气 克隆 |
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