鱼类干扰素调节因子IRF4亚家族进化及分化分析 |
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引用本文: | 庹锐,万晶,杨代勤,许巧情.鱼类干扰素调节因子IRF4亚家族进化及分化分析[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2014(2). |
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作者姓名: | 庹锐 万晶 杨代勤 许巧情 |
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作者单位: | 长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心; |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31101928);长江大学优秀青年教师科研基金资助项目(CYQ201305) |
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摘 要: | 为比较干扰素调节因子(IRF)4、IRF8、IRF9和IRF10在硬骨鱼类中的进化和分化情况,构建系统进化树,并采用非同义替代(Ka)与同义替代(Ks)的比值计算这几种基因在硬骨鱼类中进化率。结果表明:IRF4、IRF8、IRF9和IRF10在进化树上各成一支,硬骨鱼类IRF4进一步分化为IRF4a和IRF4b。4个基因的Ka/Ks值均小于1,说明这些基因在硬骨鱼类进化过程中是负选择,提示在不同物种中这些基因保持原有的功能并趋于稳定。尽管如此,不同基因进化速率存在明显差异。IRF9、IRF10、IRF4a、IRF4b和IRF8进化率分别为0.50、0.30、0.20、0.25和0.15。充分表明在硬骨鱼类进化过程中IRF8、IRF4a和IRF10分化程度低,而IRF4b和IRF9分化程度高。
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关 键 词: | 硬骨鱼类 干扰素调节因子 进化 |
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