| 猪诺如病毒巢式RT-PCR检测方法的建立与应用 |
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| 引用本文： | 陈燕君,唐玉新,周信荣,宋德平,黄瑫,彭棋,李安琪,张帆帆,张田生,叶昱,吴琼. 猪诺如病毒巢式RT-PCR检测方法的建立与应用[J]. 江西农业大学学报, 2016, 0(2): 338-346. DOI: 10.13836/j.jjau.2016048 |
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| 作者姓名： | 陈燕君 唐玉新 周信荣 宋德平 黄瑫 彭棋 李安琪 张帆帆 张田生 叶昱 吴琼 |
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| 作者单位： | 江西农业大学 动物科学技术学院,江西 南昌,330045 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31260611，31372457)，江西省研究生创新专项资金项目(YC2014-S181)，江西省自然科学基金项目(2013BAB204017)，江西省落地计划(2013BAB204017) Project supported by the National Nature Science Foundation of China(31260611，31372457)，Funding from the Innovation Fund Designated for Graduate Students of Jiangxi Province(YC2014-S181)，Nature Science Founda-tion of Jiangxi Province，China(2013BAB204017)，the Landing Program Fund of Jiangxi Province，China(2013BAB204017) |
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| 摘 要： | 为了解中国猪群中猪诺如病毒感染情况,本研究根据猪诺如病毒保守的RNA依赖性RNA多聚酶(RNA Dependent RNA Polymerase,RDRP)基因序列设计了一套巢式RT-PCR引物,用该引物从猪粪便样品中扩增出与预期目的产物大小一致的条带,经克隆、测序后获得的序列与GenB ank数据库序列比对,证明所扩增的序列属于猪诺如病毒,表明本研究成功建立了猪诺如病毒巢式RT-PCR检测方法。该检测方法具有高特异性和敏感性,应用该方法检测某猪场健康育肥猪粪便样品,阳性率为54.5%。通过RDRP基因进行核苷酸同源比对发现本文获得的猪诺如病毒Wuning 1株属于GII群诺如病毒,与美国猪诺如病毒毒株OH-QW101/03/US、中国猪诺如病毒毒株Norovirus pig/GII/Ch6/China/2009核苷酸序列同源性最近。值得注意的是猪诺如病毒Wuning1毒株与武汉人诺如病毒毒株E2120/CHN/2010核苷酸同源性高达77.1%,说明猪诺如病毒Wuning 1毒株与武汉人诺如病毒基因组上亲缘性较近。本研究成功建立了一种检测猪诺如病毒的巢式RT-PCR方法,并应用于临床猪粪便样品的检测,为猪诺如病毒的诊断与监测提供了可供借鉴的方法、为猪诺如病毒的进化、分子病毒学及与人诺如病毒关系的深入研究提供依据。
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| 关 键 词： | 猪诺如病毒 巢式RT-PCR 同源性分析 系统进化树分析 |
Development and Application of a Nested RT-PCR Assay for Detection of Porcine Norovirus |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine norovirus nested RT-PCR homology analysis phylogenetic analysis |
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