玉米GRAS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析 |
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引用本文: | 吴占清,陈威,赵展,许海良,李豪远,彭星星,陈东旭,张明月.玉米GRAS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析[J].中国农业科技导报,2024(3):15-25. |
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作者姓名: | 吴占清 陈威 赵展 许海良 李豪远 彭星星 陈东旭 张明月 |
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作者单位: | 1. 开封市农林科学研究院;2. 开封大学信息工程学院,河南省高标准农田智能灌溉工程研究中心,开封市农业物联网工程技术中心 |
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摘 要: | GRAS基因家族是植物中广泛存在的一类转录因子,在植物生长发育、生物和非生物逆境胁迫、光信号和激素信号应答等多个过程中发挥重要作用。对玉米GRAS基因家族成员的理化性质、染色体定位、系统发育、顺式作用元件等特征进行了分析。结果表明,在玉米全基因组中共鉴定出49个ZmGRAS基因,不均匀地分布于1~10号染色体上,编码蛋白质理化性质差异较大,可能在不同的微环境下发挥作用。系统进化分析将GRAS蛋白分为8个亚家族,可能在调节自身生长发育、逆境应答等过程中具有重要作用。玉米GRAS基因家族的启动子区含有激素应答、光响应、胁迫应答等多种顺式作用元件,推测其可能响应激素、胁迫等多种信号。共线性分析显示,具有共线性关系的基因可能是染色体片段复制的结果,且属于同一亚家族,具有相似的结构和功能。研究结果为进一步研究玉米GRAS基因的功能和逆境胁迫响应机制提供了依据。
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关 键 词: | 玉米 GRAS基因家族 全基因组鉴定 生物信息学 分析 |
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