极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基基因的生物信息学分析(摘要) |
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作者姓名: | 刘士伟 刘杰 李博生 |
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作者单位: | 刘士伟,李博生(北京林业大学生物科学与技术学院,北京,100083);刘杰(北京林业大学螺旋藻研究所,北京,100083) |
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基金项目: | 国家林业公益性行业科研专项资助,教育部重点研究项目(102023). Supported by the Special Project for Public-welfare Industry of Chinese Forestry,The Key Project of Chinese Ministry of Education |
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摘 要: | [目的]对极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基进行分析研究,为该蛋白的后续研究提供依据。[方法]用生物信息学分析方法对已经在GenBank上登录的极大螺旋藻藻胆蛋白的α亚基基因(GenBank AF441177)及其翻译的氨基酸序列进行了其组成和相关性质的分析、蛋白质信号肽预测、跨膜结构域的预测及亲水性/疏水性的测定,同时构建了分子进化树,对上述结果进行了分析和探讨。[结果]该蛋白的氨基酸组成丰富,不仅含18种必需氨基酸还含有含有甘氨酸、天冬氨酸等非必需氨基酸;对该蛋白信号肽和跨膜结构域分析表明,其属于胞内蛋白;对该蛋白的亲水性分析表明,其属于亲水性蛋白;进化树分析表明,该蛋白与节旋藻的同源性高,达99%~100%。[结论]该研究为α亚基和β亚基之间的关系和相互作用提供了一定依据。
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关 键 词: | 藻胆蛋白 α亚基 生物信息学 |
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