| 春小麦主要籽粒性状的全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 严勇亮,张 恒,张金波,时晓磊,耿洪伟,肖 菁,路子峰,倪中福,丛 花. 春小麦主要籽粒性状的全基因组关联分析[J]. 麦类作物学报, 2022, 0(10): 1182-1191 |
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| 作者姓名： | 严勇亮 张 恒 张金波 时晓磊 耿洪伟 肖 菁 路子峰 倪中福 丛 花 |
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| 作者单位： | （1. 中国农业大学农学院，北京 100193；2. 新疆农业科学院农作物品种资源研究所，新疆乌鲁木齐 830091；3. 新疆农业科学院国际科技合作交流处，新疆乌鲁木齐 830091；4. 新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室，新疆乌鲁木齐 830052） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31660389，U1403185); 乌鲁木齐市科学技术计划项目(Z161210002); 新疆维吾尔自治区农牧业骨干人才培养项目 |
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| 摘 要： | 为挖掘控制春小麦主要籽粒性状的关联SNP及候选基因，以国外引进品种、新疆地方品种、新疆自育品种共298份春小麦品种为材料，利用小麦55K SNP芯片，对5个环境下小麦千粒重、粒长、粒宽3个主要籽粒性状进行基于Q+K混合线性模型(mixed linear model, MLM)的全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。结果表明，供试小麦品种的3个主要籽粒性状在5个环境下的变异系数为3.89%～19.77%,其中粒宽的变异幅度最小，千粒重的变异幅度最大。不同环境中，新疆育成品种的3个主要籽粒性状的平均值均最高，而新疆地方品种的3个籽粒性状的平均值均最低。GWAS结果表明，共检测到84个与小麦主要籽粒性状显著关联的稳定SNP位点，它们分布在小麦的21条染色体上，单个SNP位点可解释3.74%～11.18%的表型变异。在1B、2B、3B、4B、5A、5D染色体上检测到6个同时关联多个籽粒性状的稳定位点。对84个SNP位点进行候选基因筛选，筛选到6个可能与小麦主要籽粒性状相关的候选基因，可作为小麦籽粒研究的重要基因。
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| 关 键 词： | 小麦 籽粒性状 全基因组关联分析 SNP 候选基因 |
Genome-Wide Association Study of Grain Traits of Spring Wheat |
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| YAN Yongliang,ZHANG Heng,ZHANG Jinbo,SHI Xiaolei,GENG Hongwei,XIAO Jing,LU Zifeng,NI Zhongfu,CONG Hua. Genome-Wide Association Study of Grain Traits of Spring Wheat[J]. Journal of Triticeae Crops, 2022, 0(10): 1182-1191 |
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| Authors: | YAN Yongliang ZHANG Heng ZHANG Jinbo SHI Xiaolei GENG Hongwei XIAO Jing LU Zifeng NI Zhongfu CONG Hua |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat Grain traits Genome-wide association analysis SNP Candidate genes |
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