| 波罗蜜叶绿素缺失突变体嫩茎转录组分析 |
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| 引用本文： | 郑李婷,于旭东,蔡泽坪,罗佳佳,吴繁花,董俊娜,曹佩娜.波罗蜜叶绿素缺失突变体嫩茎转录组分析[J].热带作物学报,2020,41(8):1513-1221. |
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| 作者姓名： | 郑李婷 于旭东 蔡泽坪 罗佳佳 吴繁花 董俊娜 曹佩娜 |
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| 作者单位： | 1.海南大学林学院/热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海南海口 5702282.海南大学热带作物学院,海南海口 5702283.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部热带作物种质资源利用重点实验室,海南儋州 5717374.海南大学生命科学与药学院,海南海口 570228 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金项目(319MS017);现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-11-HNCYH);海南大学科研启动基金项目(kyqd1620) |
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| 摘 要： | 为探究叶绿素合成缺失对波罗蜜嫩茎发育的影响,以波罗蜜叶绿素缺失突变体（chlorophyll deficient mutant, CDM）嫩茎为材料进行转录组分析;经de novo组装后获得295 869个Unigenes,使用NR、NT、Swissprot、KEGG、KOG、Pfam和GO数据库进行序列比对,共注释了174 291个Unigenes。过滤低丰度基因后,筛选出22 988个差异基因。与对照（CK）相比,CDM中上调基因有379个,下调基因有22 609个。GO分类结果表明,共有3712个基因获得注释,并将其划分为分子功能（molecular function）、细胞组分（cellular component）和生物学过程（biological process）三大类,共48个功能组;此外,有2080个Unigenes参与到19条KEGG通路上,其中在黄酮类生物合成途径中有30个Unigenes。该研究通过转录组测序,分析叶绿素合成缺失对波罗蜜嫩茎发育的影响,为木本植物茎发育的研究提供数据基础。
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| 关 键 词： | 波罗蜜 叶绿素缺失突变体 嫩茎 转录组分析 |
| 收稿时间： | 2019-11-02 |
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