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土壤镰孢菌Real-Time QPCR定量方法的建立及应用
引用本文:魏巍,许艳丽,刘金波,李春杰,韩晓增,李文滨,李淑娴.土壤镰孢菌Real-Time QPCR定量方法的建立及应用[J].大豆科学,2010,29(4).
作者姓名:魏巍  许艳丽  刘金波  李春杰  韩晓增  李文滨  李淑娴
作者单位:中国科学院,东北地理与农业生态研究所,黑龙江,哈尔滨,150081;大豆生物学教育部重点实验室,黑龙江,哈尔滨,150030;中国科学院,研究生院,北京,100049;中国科学院,东北地理与农业生态研究所,黑龙江,哈尔滨,150081;中国科学院,东北地理与农业生态研究所,黑龙江,哈尔滨,150081;中国科学院,研究生院,北京,100049;大豆生物学教育部重点实验室,黑龙江,哈尔滨,150030;Crop Genetics Research Unit(CGRU), United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service(USDA-ARS), Stoneville 38776, USA
基金项目:中国科学院知识创新工程重大资助项目,大豆生物学省部共建教育部重点实验室开放基金资助项目,国家"十一五"科技支撑计划资助项目 
摘    要:基于镰孢菌ITS序列,设计一对应用于实时荧光定量PCR(Real-Time QPCR)反应的镰孢菌属特异性引物TS和TR,并建立了相应的Real-Time QPCR体系.应用该反应体系,绝对定量了无肥(NF)、化肥(NP)以及化肥配施有机肥(NPM)等3种施肥措施下大豆田土壤镰孢菌DNA含量.结果表明:引物TS和TR对镰孢菌属真菌有较好的特异性;Real-Time QPCR反应的扩增曲线中各梯度浓度标准品的循环阈值(Ct值)间隔均匀,熔点曲线无杂峰,标准曲线的相关系数R2=0.993,斜率为-0.2927;在大豆生育时期的苗期,NF、NP及 NPM 措施下土壤镰孢菌总DNA每克干土中含量分别为18.33、44.61和140.83 pg,且NPM 措施含量极显著高于NF 及 NP 措施(P<0.01).

关 键 词:镰孢菌  实时荧光定量  PCR  绝对定量

Development and Application of a Real-Time Quantitative PCR Assay for Detection of Fusarium spp. in Soil
WEI Wei,XU Yan-li,LIU Jin-bo,LI Chun-jie,HAN Xiao-zeng,LI Wen-bin,LI Shu-xian.Development and Application of a Real-Time Quantitative PCR Assay for Detection of Fusarium spp. in Soil[J].Soybean Science,2010,29(4).
Authors:WEI Wei  XU Yan-li  LIU Jin-bo  LI Chun-jie  HAN Xiao-zeng  LI Wen-bin  LI Shu-xian
Abstract:
Keywords:
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