| 小麦miRNA启动子的基因组分析 |
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| 引用本文： | 任治鹏,王多佳,田 宇,娄贵成,李 畅,王政委,张 达,苍 晶.小麦miRNA启动子的基因组分析[J].麦类作物学报,2021,41(12):1452-1458. |
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| 作者姓名： | 任治鹏 王多佳 田 宇 娄贵成 李 畅 王政委 张 达 苍 晶 |
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| 作者单位： | 东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150030 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31971831） |
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| 摘 要： | MicroRNA(miRNA)是一类非编码RNA，与植物的生长发育及胁迫响应密切相关。为给小麦miRNA的转录调控以及新miRNA的预测提供参考依据，本研究通过小麦miRNA基因定位、启动子预测以及顺式作用元件鉴定等方法对小麦miRNA启动子进行了基因组分析，结果表明，小麦基因组中有105个pre-miRNA位于150个基因座上，大部分为单拷贝。148个miRNA基因座具有潜在启动子区域，其中115个miRNA基因至少能够预测到一个启动子。保守性及基因位置不同的miRNA的启动子转录起始位点（TSS）分布也稍有不同，但大多数位于上游序列近端区域。对miRNA基因TSS上游序列的顺式作用元件分析发现，miRNA启动子区域存在与胁迫响应相关的基序，且小麦中存在3个miRNA启动子特异性基序。61.4%的小麦miRNA启动子区域有CpG岛分布。
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| 关 键 词： | 小麦 miRNA 启动子 顺式作用元件 基因组 |
Genomic Analysis of Wheat MicroRNA Promoters |
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| REN Zhipeng,WANG Duoji,TIAN Yu,LOU Guicheng,LI Chang,WANG Zhengwei,ZHANG D,CANG Jing.Genomic Analysis of Wheat MicroRNA Promoters[J].Journal of Triticeae Crops,2021,41(12):1452-1458. |
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| Authors: | REN Zhipeng WANG Duoji TIAN Yu LOU Guicheng LI Chang WANG Zhengwei ZHANG D CANG Jing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat miRNA Promoter Cis-acting element Genome |
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