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小麦类病变LSD基因全基因组鉴定与转录组分析
引用本文:卢 晨,牛红莉,何小行,尹军良,马东方. 小麦类病变LSD基因全基因组鉴定与转录组分析[J]. 植物保护, 2021, 47(6): 180-189
作者姓名:卢 晨  牛红莉  何小行  尹军良  马东方
作者单位:1. 长江大学农学院, 湿地生态与农业利用教育部工程研究中心, 主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心, 荆州 434025; 2. 中国农业科学院植物保护研究所, 植物病虫害生物学国家重点实验室, 北京 100193
基金项目:湖北省教育厅科学研究计划重点项目(D20191305)
摘    要:类病变(lesion simulating disease, LSD)基因编码锌指蛋白家族, 在细胞程序性死亡(PCD)和其他生物过程中发挥作用。本研究鉴定了普通小麦Triticum aestivum和其3种亚基因组供体乌拉尔图小麦T.urartu、野生二粒小麦T.dicoccoides和节节麦Aegilops tauschii中LSD基因家族。结果表明, 普通小麦、乌拉尔图小麦、野生二粒小麦和节节麦中分别含有24、4、10个和5个LSD基因; 同源性分析表明, 普通小麦相关的同源物共70对, 有38对旁系同源物(54%)。蛋白质特征显示, 13个(54%)TaLSD基因含有3个zf-LSD1结构域, 大部分TaLSD为碱性蛋白质、不稳定蛋白质和非亲水蛋白质; 转录组分析表明, 小麦LSD基因的表达量与禾谷镰刀菌、白粉菌和条锈菌的侵染紧密相连。

关 键 词:类病变   小麦   同源性分析   蛋白特征   转录组分析
收稿时间:2020-07-29
修稿时间:2020-09-10

Genome-wide identification and transcriptome analysis of lesion simulating disease (LSD) gene family in wheat
LU Chen,NIU Hongli,HE Xiaohang,YIN Junliang,MA Dongfang. Genome-wide identification and transcriptome analysis of lesion simulating disease (LSD) gene family in wheat[J]. Plant Protection, 2021, 47(6): 180-189
Authors:LU Chen  NIU Hongli  HE Xiaohang  YIN Junliang  MA Dongfang
Affiliation:1. Hubei Collaborative Innovation Center for Grain Industry, Engineering Research Center of Wetland Ecology and Agricultural Use, Ministry of Education, College of Agriculture, Yangtze University, Jingzhou 434025, China; 2. State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China
Abstract:
Keywords:
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