| 利用小RNA深度测序技术鉴定上海地区‘红美人’柑橘病毒种类 |
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| 引用本文： | 张丽勍,#,管丽琴#,蒋飞,方献平,李水根,张学英.利用小RNA深度测序技术鉴定上海地区‘红美人’柑橘病毒种类[J].植物保护,2021,47(6):102-108. |
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| 作者姓名： | 张丽勍 # 管丽琴# 蒋飞 方献平 李水根 张学英 |
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| 作者单位： | 1. 上海市农业科学院林木果树研究所, 上海201403; 2. 上海市设施园艺技术重点实验室, 上海201403; 3. 上海市嘉定区农业技术推广服务中心, 上海201800; 4. 上海市柑桔研究所, 上海201913 |
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| 基金项目： | 上海市农委科技兴农项目(2019-02-08-00-16-F01126) |
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| 摘 要： | 为明确上海地区‘红美人’柑橘的病毒种类, 2020年4月在崇明、金山、奉贤、嘉定、闵行和浦东采集疑似病毒感染的叶片样品11份, 采用小RNA深度测序技术结合RT-PCR对不同来源的混合样品进行病毒种类鉴定。结果表明, 样品中含有柑橘衰退病毒Citrus tristeza virus (CTV)、柑橘黄化脉明病毒Citrus yellow vein clearing virus(CYVCV)、柑橘树皮裂纹类病毒Citrus bark cracking viroid(CBCVd)和柑橘类病毒Ⅴ Citrus viroid V(CVd-Ⅴ)。同时发现, 上海地区‘红美人’柑橘病毒复合侵染现象普遍。基于CTV和CYVCV的CP全长基因及CBCVd和CVd-Ⅴ全基因组序列系统进化分析结果表明:除了CYVCV的分离物与地理来源具有明显的相关性外, 其余病毒及类病毒均没有严格的地域相关性。研究结果为开展‘红美人’柑橘种苗病毒检测及病毒病的防治奠定基础。
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| 关 键 词： | 柑橘 小RNA深度测序 病毒鉴定 |
| 收稿时间： | 2020/8/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/9/16 0:00:00 |
Identification of the viruses from Hongmeiren citrus in Shanghai by small RNA sequencing |
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| ZHANG Liqing,#,GUAN Liqin#,JIANG Fei,FANG Xianping,LI Shuigen,ZHANG Xueying.Identification of the viruses from Hongmeiren citrus in Shanghai by small RNA sequencing[J].Plant Protection,2021,47(6):102-108. |
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| Authors: | ZHANG Liqing # GUAN Liqin# JIANG Fei FANG Xianping LI Shuigen ZHANG Xueying |
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| Institution: | 1. Forest & Fruit Research Institute, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China; 2. Shanghai Key Laboratory of Protected Horticultural Technology, Shanghai 201403, China; 3. Shanghai Jiading District Agricultural Technology Extension Service Center, Shanghai201800, China; 4. Shanghai Citrus Research Institute, Shanghai 201913, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | citrus small RNA sequencing virus identification |
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