| 甘蔗CDK基因的cDNA全长克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 苏亚春,黄珑,凌辉,王竹青,刘峰,苏炜华,黄宁,吴期滨,高世武,阙友雄.甘蔗CDK基因的cDNA全长克隆与表达分析[J].作物学报,2017,43(1):42-50. |
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| 作者姓名： | 苏亚春 黄珑 凌辉 王竹青 刘峰 苏炜华 黄宁 吴期滨 高世武 阙友雄 |
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| 基金项目： | This work was supported by Natural Science Foundation of Fujian Province, China (2015J06006), the Program for New Century Excellent Talents in Fujian Province University (JA14095), the Program of Introducing International Super Agricultural Science and Technology (948 Program) (2014-S18), and the China Agriculture Research System (CARS-20). |
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| 摘 要： | 植物细胞周期依赖性蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,与周期蛋白(Cyclins)协同作用,是重要的细胞周期性调控因子。本研究从甘蔗受花叶病毒侵染的转录组数据库中获得一条与高粱(Sorghum bicolor)CDK基因(Gen Bank登录号为XP_002466536.1)高度同源的Unigene序列,通过RT-PCR扩增获得长度为1799 bp的甘蔗Sc CDK基因(Gen Bank登录号为KR258796)。序列分析显示Sc CDK基因含一个完整的开放阅读框(65~1603 bp),编码512个氨基酸,且具有CDK典型保守结构域,如ATP结合位点、磷酸结合位点及活化环A-loop。此外,生物信息学预测显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为可溶性蛋白,不存在信号肽,二级结构元件多为无规则卷曲,主要参与蛋白翻译。实时荧光定量PCR分析表明,Sc CDK基因的表达具有组织特异性,其在蔗芽上的表达量最高,其次是在蔗肉、蔗根、叶鞘和蔗皮中;在PEG、Na Cl和ABA的胁迫诱导过程中,Sc CDK均表现上调作用,且受ABA胁迫后表达量最高,约为对照组的1.9倍。推测该基因的表达与甘蔗抗干旱和抗渗透胁迫有关,同时受ABA的诱导,参与细胞周期分裂。
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| 关 键 词： | 甘蔗 CDK基因 同源克隆 生物信息学分析 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2015-12-31 |
Cloning and Expression Analysis of CDK Gene in Sugarcane |
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| SU Ya-Chun,HUANG Long,LING Hui,WANG Zhu-Qing,LIU Feng,SU Wei-Hua,HUANG Ning,WU Qi-Bin,GAO Shi-Wu,QUE You-Xiong.Cloning and Expression Analysis of CDK Gene in Sugarcane[J].Acta Agronomica Sinica,2017,43(1):42-50. |
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| Authors: | SU Ya-Chun HUANG Long LING Hui WANG Zhu-Qing LIU Feng SU Wei-Hua HUANG Ning WU Qi-Bin GAO Shi-Wu QUE You-Xiong |
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| Institution: | Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding (Fujian), Ministry of Agriculture / Fujian Agriculture and Forestry University / Sugarcane Research & Development Center, China Agricultural Technology System, Fuzhou 350002, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sugarcane CDK Homology cloning Bioinformatics analysis Real-time PCR |
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