陆地棉MS5同源基因的电子克隆及序列分析

高等植物MS5基因的异常表达可导致雄性不育的发生。本研究利用EST数据库,在陆地棉隐性雄性不育系洞A中通过电子克隆获得1个棉花MS5同源基因,命名为GhMS5。采用RT-PCR方法验证GhMS5基因的cDNA序列,并利用在线分析平台和生物软件对该基因进行生物信息学分析。结果显示,RT-PCR验证编码区序列与电子克隆序列一致;获得的GhMS5基因cDNA长1 631 bp,包含一个长1 437 bp的完整开放阅读框,编码478个氨基酸;其分子量为53 240,等电点为9.25;GhMS5蛋白质具有典型的TPR保守结构域;此蛋白质不存在信号肽及跨膜结构,可能定位于叶绿体,二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。表明电子克隆能用于棉花基因的分离。